苦荞SAUR家族基因功能解析.pdfVIP

摘要

苦荞麦（Fagopyrumtataricum(L.)Gaertn.）俗称“苦荞”，蓼科荞麦属，双子叶植

物。苦荞作为一种功能性食品，富含膳食纤维、芦丁和多酚等成分，与普通荞麦相比

具有更高的药用、食用、研究价值，因此受到了人们的青睐和国内外学者的广泛关注。

生长素是最早被发现的一类植物激素，通过诱导生长素早期响应基因的表达，进而调

控植物的生长发育与逆境反应。SAUR家族是生长素响应最为强烈的家族基因之一，

一些研究已表明SAUR家族基因在拟南芥、水稻等植物的根系发育、应对非生物胁迫、

合成与转运中发挥着关键作用，但是关于苦荞响应生长素的机制还不了解，苦荞SAUR

家族基因方面的研究鲜有报道，目前对苦荞SAUR家族基因的功能，以及对生长素的

调控机制尚不清楚。因此，亟需对苦荞进行响应生长素刺激的转录组分析，探讨与IAA

响应的相关性，对苦荞SAUR家族基因进行鉴定解析，对其家族成员的功能进行探索，

以促进苦荞产业的发展，为苦荞种质资源、基因资源的研究提供理论基础。本研究探

讨了苗期苦荞对生长素的响应差异，通过高通量转录组分析，在苦荞叶片和根中分别

鉴定差异表达基因（DEG）后，富集分析显示这些DEGs在植物激素信号转导、植物

MAPK信号通路富集，被确认的基因含有SAUR家族基因，因此我们利用生物信息学

手段对苦荞SAUR家族基因进行鉴定与分析，并采用实时荧光定量技术分析了SAUR

家族在苦荞各组织中的表达量，通过RNA-seq数据获得了FtSAURs在苦荞组织中的

特异性表达谱；在苦荞中克隆出95个SAUR家族基因后，构建了植物表达载体，通

过农杆菌侵染拟南芥，对阳性苗T0代与T1代进行盐胁迫和干旱胁迫，鉴定其表型

并分析转基因植株在逆境胁迫下的表达模式。本研究的主要结果如下：

1.苦荞苗期经IAA处理后，通过高通量转录组分析，在苦荞叶片和根中分别鉴

定出3355个和397,415个DEGs。这些DEGs在植物激素信号转导、植物MAPK信

号通路、类苯丙烷生物合成途径和类黄酮生物合成途径中显著富集。这表明苦荞的组

织与IAA响应有显著的相关性，尽管在响应趋势上有显著差异。叶片和组织中特异

性表达基因的鉴定也存在组织差异，IAA处理后发现更多的特异性表达基因，说明

IAA显著调节苦荞组织的生长。本研究还确认了部分基因，特别是植物激素信号转导

通路上的24个差异表达基因，其中包括两个SAUR家族基因。

2.通过生物信息学方法对苦荞SAUR家族基因进行鉴定与分析，共鉴定到95个

SAUR家族基因，根据在染色体上的位置分别命名为FtSAUR01-FtSAUR95，我们发现

95个FtSAURs中，88个不含内含子，7个成员含有1个内含子，这与其他植物中的

表达趋势一致。FtSAURs结构简单，FtSAURs的开放阅读框长度通常为180-540bp，

结构分析显示，大多数FtSAURs在其SSD中也有4个保守基序I-IV，具有高度保守

的功能域和相似的排列序列。启动子分析显示苦荞SAUR家族具有大量的激素响应和

逆境胁迫响应结构，有效地促进了植物感知生长素后SAURs的快速转录和翻译，响

应逆境胁迫，参与信号转导途径。

3.本研究利用qRT-PCR分析了苦荞根、茎、叶、花、种子的表达模式，检测到

24个未表达的基因，在其余基因中，17个基因在特定组织中表达，另有10个基因在

营养组织或生殖组织中显著表达，表明FtSAURs广泛参与荞麦的生长发育。由于SAUR

家族广泛参与激素应答，本研究分析了IAA处理后荞麦中FtSAURs的表达情况，发

现35个基因在处理后获得或失去表达，经IAA处理后，5个基因表达变化显著。同

样，干旱处理后有19个基因表达显著变化，盐处理后有13个基因表达显著变异，证

明了FtSAURs在苦荞生长和组织表达中具有丰富的调控作用。

4.为进一步探究FtSAURs的功能，本研究克隆了95个SAUR家族基因，构建95

个表达载体，将多个表达载体转入模式植物拟南芥后，对转基因拟南芥在干旱、低盐

胁迫下的表型进行鉴定。我们发现，在一定盐环境下，FtSAUR07转基因株系能促进

根生长，比野生型具有更强的适应性。而在干旱