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洋葱WRKY基因家族鉴定及其在鳞茎发育过程中的表达分析
摘要:为了探讨洋葱WRKY转录因子家族的功能,本研究基于洋葱全基因组和鳞茎不同发育时期的转录组数据,利用生物信息学方法筛选并鉴定到55个AeWRK基因家族成员,其编码蛋白序列长度为144-683aa,等电点为5.11-9.65,脂肪系数为47.14-77.24,均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果表明,这55个AcWRKY蛋白都定位在细胞核中。进化树分析显示,洋葱WRXY家族基因分为CroupI、CroupⅡ和CroupⅢ三大类,其中CroupⅡ组可进一步分为5个亚组,洋葱和拟南芥WRKY蛋白在各组中均有分布,推测相同组或亚组中洋葱与拟南
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