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天然产物靶点识别技术的新进展
目录
一、文档综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2天然产物概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.3靶点识别技术概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.4本文档研究内容与结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
二、天然产物与生物靶点交互机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.1天然产物化学结构与多样性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
2.1.1结构类型分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1.2生物活性谱．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
2.2生物靶点结构与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
2.2.1酶促反应机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
2.2.2受体蛋白特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
2.3两者交互作用原理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
2.3.1分子对接理论基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
2.3.2相互作用力分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
三、基于计算模拟的靶点识别技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
3.1分子对接技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
3.1.1算法流程详解．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
3.1.2参数设置优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
3.2量子化学计算方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
3.3虚拟筛选策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
3.3.1数据库构建过程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
3.3.2筛选模型构建与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
3.4统计学习与机器算法应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
3.4.1模型训练与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
3.4.2预测性能评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
四、实验验证与验证技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
4.1样品制备与提取方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54
4.1.1生物材料来源选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
4.1.2提取纯化技术优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
4.2靶点结合实验技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．63
4.3药理活性验证实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67
4.3.1细胞水平活性测试．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69
4.3.2动物模型药效验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71
4.4基于组学的靶点验证方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．72
五、新兴技术与应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．73
5.1人工智能与深度学习．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74
5.1.1神经网络模型构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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