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质谱技术与临床微生物
——MALDI-TOFMS;内容简介;临床微生物鉴定措施学的演化;4;;基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱
(MALDI-TOFMS);;核糖体蛋白
产生多
高保守
与rRNA基因有关
受培养条件影响小;;不一样菌种–不一样蛋白指纹图谱;11;;通过图形相配来鉴定;“谱图模式比对”的细菌鉴定成果的汇报须人工选择最终止果;15;不一样培养基的影响;不一样菌龄的影响;不一样菌量的影响;质数据库构建思绪;20;
1046菌种
13,790以上分离株(数据库里的菌株)
29,873以上图谱
平均每个菌种有18菌株
平均每个菌种有40个图谱
;内容简介;卫计委对微生物试验室的规定;来自临床医生的期望;怎样处理临床迅速、精确诊断的需要
与现行临床微生物检查能力的冲突
——通过改善措施学和试验流程;速度
平均1分钟完毕1-2菌株鉴定
菌谱
1000种(包括丝状真菌、厌氧菌、奴卡氏菌、分支杆菌等等)
成本低;1.挑菌落;呼吸道、肠道标本的细菌种类繁多,常规的鉴定成本高或者操作麻烦,轻易遗漏或者忽视某些细菌。
院感的标本也存在种类多,成本高的问题,尤其碰到MRSA和VRE,需要花费诸多时间和精力去鉴定。
厌氧菌、弯曲菌、分枝杆菌和真菌:细菌鉴定的死角,技术上不好掌握或者目前的措施难以实行。
微生物的分级汇报制度:存在诸多变数,使得初次汇报的成果可靠性得不到临床的承认。(例如:直接涂片,初步能估计细菌大类,不过无法确切的到种,和耐药状况。);Multicentervalidationofthe?VITEK?MS?v2.0MALDI-TOFmassspectrometrysystemfortheidentificationoffastidiousgram-negativebacteria.;ASM丝状真菌研究;质谱Nocardiaspecies;尿标本直接鉴定:;老式培养措施和质谱直接鉴定措施对比;脑脊液标本直接鉴定:;血培养直接鉴定:;(1)临床样本中细菌的量
为了得到精确的鉴定图谱,MALDI-TOFMS技术对置于靶板上的细菌的最低检测限约为(1x104)~(1x106)cfu/mL。若要直接检测拟似血流感染的血液样本以及拟似泌尿系统感染的中段尿等临床样本中的病原菌,首先必须富集细菌;
(2)临床样本的质
由于血液和血培养瓶中的大分子成分如血红蛋白和其他蛋白成分、尿液中的白细胞等有机成??会干扰细菌的谱峰,因此直接检测前需要采用预处理措施清除这些干扰原因。;直接鉴定阳性血培养瓶内微生物,不一样文献报道的种水平的鉴定率在54%~99%不等,重要是由于所鉴定细菌种类/数量的不一样,或是运用了不一样的预处理/提取措施。;KROUMOVA等在质谱法分析实行蛋白提取程序之前,将样本富集到一种增菌培养基中孵育大概2h后再进行质谱分析,同步到达增菌和减少血液成分干扰的目的,提高了鉴定分数,使鉴定成果更可信;
IDELEVICH等将血培养阳性的样本转种到血平板孵育1.5、2、3、4、5、6、7、8、12和24h(对照),分别直接进行MALDI-TOFMS检测,直到有可靠的到种水平的鉴定成果出现,成果发现革兰阳性球菌平均鉴定到种所需要的孵育时间是5.9h,革兰阴性杆菌平均鉴定到种所需要的孵育时间是2h。
HONG等的研究也表明,这种措施能得到可靠的鉴定成果(与老式生化措施的属水平的一致率是98.9%);成本、流程、时效
不会受血培养系统的影响
同步到达增菌和减少血液成分干扰的目的
成本低,易于操作
提高了鉴定分数,使鉴定成果更可信;ImpactofRapidOrganismIdentificationviaMatrix-AssistedLaserDesorption/Ionization
Time-of-FlightCombinedWithAntimicrobialStewardshipTeamInterventioninAdultPatientsWithBacteremiaandCandidemia
由质谱迅速分析及迅速药敏介入临床抗生素管理小组执行成人菌血症及真菌血症的影响;ArchPatholLabMed.;137:1247–1254;内容简介;Epidemiology(straintyping)*流行病学分析(菌株分型)
Resolutionuncertain目前对于分型精度存在争议
RequirescomparisonwithreferencemethodslikePFGEandMLSTforavari
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