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2025年大学《生物信息学》专业题库——基因组学对动植物遗传相似性的贡献

考试时间:______分钟总分:______分姓名:______

一、选择题(每题2分,共20分。请将正确选项字母填入括号内)

1.下列哪种测序技术能够提供较长的读长,有助于解析基因组中的复杂区域(如重复序列)?

A.Sanger测序

B.Illumina测序

C.PacBio测序

D.ONT测序

2.在进行物种间系统发育关系研究时,选择构建系统发育树的序列应优先考虑:

A.核糖体RNA基因(rRNA)

B.线粒体DNA编码的蛋白质基因

C.高度保守的蛋白质编码基因

D.基因组中含量最多的基因

3.BLAST算法的主要目的是:

A.构建基因组的物理图谱

B.对大量序列数据进行多序列比对

C.在已知序列数据库中寻找与目标序列相似的序列

D.计算基因组的G+C含量

4.以下哪个指标通常用于衡量种群内部的遗传多样性?

A.系统发育树

B.群体分化指数(Fst)

C.基因组大小

D.同源基因比率

5.基因家族的定义通常基于:

A.基因在染色体上的位置

B.基因表达的组织特异性

C.基因功能的相似性以及序列的相似性

D.基因产物的分子量

6.利用高通量测序技术获得的一个物种的全部基因转录本集合,称为:

A.基因组DNA

B.基因组RNA

C.转录组

D.基因目录

7.在比较两个基因组时,发现一个基因组包含大量在另一个基因组中缺失的基因,这种现象被称为:

A.基因重复

B.基因丢失

C.基因偃缩

D.基因膨胀

8.构建系统发育树时,如果使用邻接法(NJ),其主要依据是:

A.最小进化距离

B.最大似然法

C.群体间的序列差异总量

D.核心基因的相似性

9.DNA条形码技术在物种鉴定中常用的片段通常是:

A.5.8SrRNA基因

B.COI基因(线粒体细胞色素C氧化酶亚基I)

C.18SrRNA基因

D.EF-1α基因

10.基因组学比较分析有助于揭示:

A.单个基因的功能

B.物种间的进化距离和关系

C.基因组的整体结构变异

D.细胞的代谢途径

二、简答题(每题5分,共25分。请简洁明了地回答下列问题)

1.简述Sanger测序和Illumina测序的基本原理的主要区别。

2.简述利用基因组学数据构建物种系统发育树的常规步骤。

3.简述什么是基因组偃缩和基因组膨胀,并举例说明其可能对物种进化产生的影响。

4.简述BLAST程序在基因组学研究中的主要应用。

5.简述基因组学在濒危动植物保护中可能发挥的作用。

三、分析题(每题10分,共20分。请结合所学知识,分析和阐述下列问题)

1.假设你获得了两种未知的动植物样本的基因组DNA,如何利用生物信息学方法初步判断它们属于同一物种还是不同物种?请简述实验设计思路和涉及的关键分析步骤。

2.比较分析利用核基因组数据和线粒体基因组数据研究一个古老类群的系统发育关系时,各自可能存在的优势和局限性。

四、论述题(10分)

论述基因组学技术的发展如何改变了我们对动植物遗传多样性和进化关系的认识。

试卷答案

一、选择题(每题2分,共20分)

1.C

2.B

3.C

4.B

5.C

6.C

7.D

8.C

9.B

10.B

二、简答题(每题5分,共25分)

1.解析思路:区分Sanger测序和Illumina测序的核心在于其反应机制和读长。Sanger测序通过链终止法,根据掺入的dNTP(各带有不同荧光标记)终止延伸,通过毛细管电泳分离片段,检测荧光信号确定序列,特点是读长较长、准确度高,但通量较低。Illumina测序是边合成边测序(或合成后检测),利用可逆terminator和荧光标记的核苷酸,通过成像装置检测每次延伸添加的核苷酸荧光信号,通常是massivelyparallel(大规模平行)测序,特点是通量极高、成本相对较低,但原始读长较短(第二代)或通过拼接可获较长读长(第三代)。

回答要点:Sanger测序基于链终止法,检测荧光标记的终止子,读长长,通量低;Illumina测序基于边合成边测序,大规模平行化进行,通量高,原始读长相对短(或通过拼接)。

2.解析思路:构建

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