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动植物总RNA提取-Trizol法
Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交,Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。
1、将组织在液N中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1mlTrizol液研磨,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。
2、研磨液室温放置5分钟,然后以每1mlTrizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒。
3、取上层水相于一新的离心管,按每mlTrizol液加0.5ml异丙醇的比例加入异丙醇,室温放置10分钟,12000g离心10分钟。
4、弃去上清液,按每mlTrizol液加入至少1ml的比例加入75%乙醇,涡旋混匀,4℃下7500g离心5分钟。
5、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。然后将RNA溶于水中,必要时可55℃-60℃水溶10分钟。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。
[注意]1、整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作。
2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上,RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周,-20℃保存一年。
Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。
TRIzol的主要成分是酚。主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。酚虽可有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。
x0.1%的8-羟基喹啉的,与氯仿联合使用可增强对RNase的抑制
x异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,并使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。
xβ-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。
在收获组织及细胞死亡之后,应立即灭活内源的RNA酶,以防止RNA降解。
以下3个方法均可有效使内源RNA酶失活:
1)用含离液(如胍盐)的细胞裂解液收获样品,并立即匀浆。
2)用液氮瞬间冻结样品。值得特别注意的是:组织块必须保证足够小,在浸入液氮的瞬间就能冻结,以确保瞬间令RNA酶失活
3)立即将样品置于RNAlater?TissueCollection:RNAStabilizationSolution中。它是一种水相、无毒的收集试剂,能立即稳定并保护完整、未冻结的组织和细胞样品中的RNA。关键要点是组织样品切片一定要够薄(0.5cm),这样RNAlater才能在RNase破坏RNA之前迅速渗入组织块中。
使用正确的细胞或组织储存条件
在样品用液氮瞬间冻结之后,应该储存在-80°C,千万不能解冻。即使是置于含有胍盐的裂解液中作匀浆前的短暂解冻,也会导致RNA的降解和损失。瞬间冻结的组织应该首先在超低温条件下先研磨成粉,然后置于裂解液中进行匀浆。
RNAlater使样品储存更为便利。储存在RNAlater中的细胞或组织可在室温下稳定保存长达1个星期,在4°C可稳定保存长达1个月,或永久保存在-20°C。有关RNAlater的更多信息请参考/techlib/resources/RNAlater.
彻底匀浆样品
细胞或组织的彻底匀浆对RNA提取来说,是一个很关键的步骤,它能够防止RNA的损失和降解。匀浆的方法应根据细胞或组织的类型来选择。大部分培养的细胞可以置于细胞裂解液中,通过简单的涡旋震荡来匀浆;而动物组织、植物组织、酵母和细菌则常常需要更加剧烈的方法。比如说细菌的细胞壁,就需要酶消化来实现彻底的细胞裂解和RNA的最大回收。有关各种不同的样本类型,哪些方法是最适合的匀浆方法,请参考/techlib/tb/tb_183.html.
在RNA提取之前预处理样品裂解液
对于某些样品来说,在匀浆之后,RNA提取之前,还需要一些额外的处理步骤。对于脂肪含量高的组织,像脑组织和脂肪组织得到的裂解液,就需要通过氯仿抽提来去除脂类,从而提高RNA产量。许多植物组织中富含多酚和多糖,会降低RNA的质量和产量,用PlantRNAIsolationAid预处理裂解液可去除这些难以处理的成分。
选择最好的RNA分离方法
现有众多的RNA分离方法也许令人难以取舍。目前最简单也是最安全的方法是柱式分离,如RNAqueous?或RNAqueous-4PCRKit。因为操作简单,所以这些步骤特别适用于同时处理多个样品。如
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