2025年大学《生物信息学》专业题库—— RNA测序数据分析在生物信息学中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——RNA测序数据分析在生物信息学中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在RNA测序数据分析中，通常需要对原始测序读长进行质量控制和过滤，以去除低质量读长和接头序列。以下哪一项不是常用的质量控制指标？

A.Q值（QualityScore）

B.读长长度分布

C.N碱基比例

D.基因组相似度

2.以下哪种RNA-Seq数据定量方法不受转录本长度的影响？

A.FPKM(FragmentsPerKilobaseoftranscriptperMillionmappedreads)

B.RPKM(ReadsPerKilobaseoftranscriptperMillionmappedreads)

C.TPM(TranscriptsPerMillion)

D.CPM(CountsPerMillion)

3.在使用DESeq2进行差异表达基因分析时，计算基因离散度（dispersion）的主要依据是？

A.每个基因在不同样本中的标准化表达量（counts）的差异

B.每个样本中所有基因的标准化表达量的变异程度

C.每个基因在不同样本中的原始测序读数（rawcounts）的差异

D.对照组基因表达量的平均值

4.以下哪种方法主要用于检测RNA转录本的可变剪接事件？

A.差异表达基因分析

B.基因集富集分析

C.RNA序列比对

D.可变剪接分析（如StringTie,Cufflinks）

5.在进行RNA-Seq数据分析时，使用STAR或HISAT2等工具进行序列比对的主要目的是？

A.计算基因表达量

B.检测基因突变

C.确定测序读长在基因组或参考转录组上的位置

D.进行样本间差异比较

6.以下哪种统计指标常用于评估差异表达分析结果的显著性，并控制假发现率（FalseDiscoveryRate）？

A.t-value

B.F-statistic

C.p-value

D.FDR(FalseDiscoveryRate)

7.GO富集分析的主要目的是？

A.确定差异表达基因的数量

B.筛选出差异表达基因中显著富集的生物学功能、过程或通路

C.计算基因表达量的平均值

D.检测RNA序列中的重复序列

8.对于一个比较处理组与对照组的RNA-Seq实验，以下哪种实验设计通常能更有效地检测到处理引起的基因表达变化？

A.单个样本进行测序

B.每个组分别进行测序，不设对照组

C.每个组设置三个生物学重复样本进行测序

D.只对处理组进行测序

9.RNA-Seq数据分析中，计算FPKM值时，“Kilobaseoftranscript”指的是？

A.该基因的编码序列（CDS）长度

B.该基因转录本的长度

C.基因组总转录本长度

D.所有测序读长总长度的千分之一

10.以下哪种工具通常用于对RNA-Seq数据进行定量和差异表达分析？

A.BLAST

B.Bowtie2

C.DESeq2

D.samtools

二、填空题（每空1分，共15分）

1.RNA测序（RNA-Seq）技术可以通过高通量测序来__________转录组的结构和丰度，从而研究基因表达调控、可变剪接等生物学过程。

2.RNA-Seq数据分析的首要步骤通常是__________，包括去除低质量读长、去除接头序列和过滤引物序列等。

3.将测序读长比对到参考基因组或转录组的工具，如STAR和HISAT2，其核心算法通常基于__________。

4.TPM（TranscriptsPerMillion）表达量值是_____________的表达量值，这使得不同长度转录本之间的表达量具有可比性。

5.在进行差异表达分析时，为了控制第一类错误（假阳性），需要计算p-value并进行__________校正。

6.除了检测基因表达差异，RNA-Seq还可以用于分析__________、长非编码RNA（lncRNA）和小RNA（miRNA）等非编码RNA的丰度和结构变异。

7.Cufflinks等软件主要用于__________，可以识别和量化转录本组装