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2025年大学《整合科学》专业题库——细胞信号传导路径的计算模拟研究
考试时间:______分钟总分:______分姓名:______
一、选择题(每题2分,共20分)
1.下列哪种分子通常不作为细胞内信号传导的第二信使?
A.cAMP
B.Ca2+
C.DAG
D.蛋白激酶A
2.在构建描述分子浓度变化的确定性信号通路模型时,通常需要考虑的主要数学工具是?
A.概率论
B.微分方程
C.离散数学
D.图论
3.当信号通路中涉及少量分子且随机事件影响显著时,更适合采用哪种模型进行分析?
A.基于质量作用定律的确定性模型
B.确定性常微分方程模型
C.随机过程模型(如StochasticModel)
D.网络模型
4.以下哪个参数通常代表信号分子与其受体结合的亲和力?
A.反应速率常数k
B.解离常数Kd
C.信号传导效率
D.反馈抑制强度
5.在信号通路计算模拟中,进行参数敏感性分析的主要目的是?
A.确定模型的最优参数值
B.评估不同参数变化对通路行为的影响程度
C.验证模型与实验数据的吻合度
D.优化模型的计算效率
6.以下哪种方法不属于从实验数据中提取信息以参数化信号传导模型的方式?
A.高通量测序分析蛋白表达量
B.酪氨酸磷酸化实验测定激酶活性
C.单细胞成像追踪单个分子事件
D.直接设定经验公式确定模型参数
7.细胞信号通路中的“级联放大”现象主要依赖于?
A.信号分子的合成与降解速率
B.多个信号分子与单一受体结合
C.单个信号分子激活多个下游效应分子
D.信号通路与细胞周期的精确同步
8.布尔网络模型主要用于描述信号通路中的?
A.分子浓度随时间的变化
B.分子间的相互作用速率
C.信号通路的逻辑关系和状态转换
D.信号通路的时空结构特征
9.计算模拟结果的可信度不仅取决于模型本身,还与什么因素密切相关?
A.模型构建者的声誉
B.模型使用的编程语言
C.用于验证模型的实验数据质量
D.模型中参数的预设值范围
10.整合科学视角下的细胞信号传导研究强调?
A.单个信号分子的精细作用机制
B.细胞内所有分子的浓度变化
C.信号通路如何与其它系统(如代谢、基因表达)相互作用
D.信号通路在特定疾病状态下的异常改变
二、填空题(每空1分,共15分)
1.细胞信号传导的基本过程通常包括______、______、______和______四个主要阶段。
2.基于常微分方程的模型,其核心思想是描述系统中各组分浓度随______的变化率。
3.在随机模型中,M分子与R分子结合后转化为P分子的事件发生的概率通常与______和______成正比。
4.信号通路中的负反馈机制对于维持______和防止______至关重要。
5.为了使计算模拟结果具有生物学意义,模型需要通过______或______进行验证。
6.信号通路计算模拟可以帮助我们理解通路行为的______,如振荡、阈值和______。
7.将高通量实验数据直接输入模型进行参数化往往需要假设数据包含了______信息。
三、简答题(每题5分,共20分)
1.简述受体酪氨酸激酶(RTK)介导的信号通路中,信号如何从细胞外传递到细胞内,并举例说明至少两种可能的下游效应。
2.简要解释确定性模型和随机模型在描述细胞信号传导时的主要区别和适用场景。
3.为什么在信号传导路径的计算模拟研究中,模型的简化是必要的?请列举至少两个简化策略。
4.描述在进行信号通路计算模拟时,确定模型参数的几种可能来源。
四、计算题(共25分)
1.(12分)考虑一个简单的信号通路模型,包含一个信号分子S,一个受体R,和一个下游效应分子P。当S与R结合后,会激活一个激酶K,K再磷酸化R并最终生成P。假设:
*S与R结合生成复合物SR的速率常数k_on=0.1M?1s?1,解离速率常数k_off=0.01s?1。
*SR分解产生P和R的速率常数k_p=0.05s?1。
*初始时,[S]?=1M,[R]?=1M,[P]?=0M。
*忽略K的合成与降解。
请建立描述该系统动态变化的确定性常微分方程
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