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·482·浙江临床医学2025年4月第27卷第4期
·论著·
肝硬化转归肝细胞癌关键基因筛选及干预中药的预测分析
潘晓豪洪耀南林展熠毛天成徐魏钦虞舒然何鹿尘王邦才*
【摘要】目的通过生物信息学技术筛选肝硬化转归为肝细胞癌的差异基因,预测干预转归进程的中药及其机制。方法从基因表达数
据库获取GSE17548、GSE36411基因芯片数据,应用R软件进行数据标准化、差异基因筛选,并进行GOKEGG富集分析。通过STRING数据库
构建蛋白-蛋白互作网络,采用R软件进行生存分析,筛选显著影响肝癌预后的基因,并通过Kaplan-Meier曲线可视化。对筛选基因进行单样
本基因集富集分析,绘制免疫浸润图,并结合CoremineMedical数据库预测潜在治疗作用的中药。结果共筛选出37个核心上调基因和150个
核心下调基因。GO富集分析主要涉及核分裂、周期蛋白依赖激酶调节因子活性、类固醇代谢和单加氧酶活性等;KEGG富集分析涉及细胞周
期、视黄醇代谢、细胞色素P450药物代谢等通路。生存分析确定10个关键基因,包括细胞环蛋白肌动蛋白结合蛋白、异常纺锤体相关基因、
极光激酶A、透明质酸介导的运动受体、细胞分裂周期20同源物、凝血因子Ⅸ和细胞色素P450家族3A4酶,这些基因显著影响肝癌预后。筛选
出的潜在中药包括丹参、五味子、柴胡、猪苓和甘草。结论本研究发现肝硬化转归为肝癌与胆汁酸谱紊乱、端粒酶再激活、内质网持续应
激等过程有关,涉及CDKN3、CYP2E1、CDC20基因的异常表达,为肝硬化和肝癌的发生发展机制研究及中药治疗选择提供了新方向。
肝硬化肝细胞癌生物信息学中药预测
【关键词】
【Abstract】ObjectiveToscreenfordifferentiallyexpressedgenesintheprogressionoflivercirrhosistohepatocellularcarcinomausing
bioinformaticstechniquesandtopredictpotentialChineseherbalmedicinesandtheirmechanismsforinterveninginthisprogression.MethodsGene
expressiondatafromtheGSE17548andGSE36411datasetswereobtainedfromthegeneexpressiondatabase.Datanormalization,screeningofdifferentially
expressedgenes,andGO/KEGGenrichmentanalyseswereperformedusingRsoftware.Protein-proteininteractionnetworkswereconstructedusing
theSTRINGdatabase.SurvivalanalysiswasconductedusingRsoftwaretoidentifygenessignificantlyaffectingtheprognosisoflivercancer,whichwere
visualizedusingKaplan-Meiercurves.Single-samplegenesetenrichmentanalysiswasperformedonthescreenedgenestogenerateimmuneinfiltration
maps.PotentialChineseherbalmedicineswiththerapeuticeffectswerepredictedusingtheCoremineMedicaldatabase.ResultsAtotalof37upregulated
coregenesand150downregulatedcoregeneswereidentified.GOenrichme
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