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福建农业学报2025,40(2):132−142
FujianJournalofAgriculturalSciencesdoi:10.19303/j.issn.1008-0384.2025.02.003
李敬,张翼翎,杨丰,等.红螯螯虾不同血细胞亚群的比较转录组学分析[J].福建农业学报,2025,40(2):132−142.
LIJ,ZHANGYL,YANGF,etal.TranscriptomicsofHemocyteSubpopulationsinCheraxquadricarinatus[J].FujianJournal
2025,40(2):132−142.
ofAgriculturalSciences,
红螯螯虾不同血细胞亚群的比较转录组学分析
*
李敬,张翼翎,杨丰,李钫
(自然资源部第三海洋研究所,福建厦门361005)
摘要:【目的】半颗粒细胞(semigranularcell,SGC)和颗粒细胞(granularcell,GC)是螯虾循环血细胞的两大主要
类群,它们代表了处于不同发育阶段的具有免疫功能的血细胞。了解SGC和GC的功能,可为深入研究甲壳动物血
细胞亚群提供基础数据。【方法】以红螯螯虾(Cheraxquadricarinatus)为试验对象,运用Percoll不连续密度梯度
离心法分离纯化SGC和GC;然后对SGC和GC进行转录组测序,并进行差异分析、GO富集分析以及KEGG富集
分析,以探究他们在功能上的差异;最后用实时定量RT-PCR对部分差异基因的表达进行验证。【结果】测序获得
了红螯螯虾血细胞的非冗余唯一基因(unigene)共116199个。这些unigenes的平均长度为763bp,N50为1313bp。
经对比共发现了4488个差异表达基因(differentiallyexpressedgenes,DEGs),其中3951个基因在SGC中高度表达,
537个基因在GC中高度表达。GO富集分析结果显示:在细胞组分类别中,SGC共富集到7个条目,GC共富集到
10个条目;在分子功能类别中,SGC共富集到31个条目,GC共富集到60个条目;在生物过程类别中,SGC共富
集到154个条目,GC共富集到102个条目。KEGG富集分析结果显示,SGC共富集到44条通路,GC共富集到
10条通路。【结论】在SGC中高度表达的DEGs主要与细胞增殖、分化、基因表达调控、酶产生、内吞作用和细
胞黏附有关;在GC中高度表达的DEGs
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