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江苏农业科学2023年第51卷第9期—41—
李浩霞,黄稳娥,柳西宁,等.枸杞实时荧光定量RT-qPCR内参基因筛选与验证[J].江苏农业科学,2023,51(9):41-51.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2023.09.006
枸杞实时荧光定量RT-qPCR内参基因筛选与验证
12222232
李浩霞,黄稳娥,柳西宁,朱馨蕾,任晓月,安巍,周军,赵建华
(1.宁夏农林科学院林业与草地生态研究所,宁夏银川750002;2.宁夏农林科学院枸杞科学研究所/
国家枸杞工程技术研究中心,宁夏银川750002;3.北方民族大学生物科学与工程学院,宁夏银川750021)
摘要:以9种不同基因型枸杞的不同组织(茎、叶、花、果)和不同发育期(FS~FS)的果实为试材,选取Act-1/
15
Act-3、Ef1a、Gapdh、H3b、Acx4、Pp2a、Rh37、Samc、Tub为候选内参基因,利用实时荧光定量技术(RT-qPCR)检测了9
个候选基因在不同基因型枸杞的不同组织和不同发育阶段果实中的表达水平。并采用geNorm、NormFinder、
BestKeeper、DeltaCt、RefFinder分析方法,评估候选内参基因的表达稳定性,并选择Beat基因验证内参基因。结果表
明,Ef1a为不同基因型枸杞的不同组织和5个发育时期果实中表达较稳定的内参基因,Gapdh为表达最不稳定的内参
基因;在宁夏枸杞中表达最稳定的内参基因为Rh37,其次为Ef1a。进一步采用Beat基因对不同基因型枸杞的不同组
织(茎、叶、花、果)和5个发育时期果实中的表达模式进行验证,表明Ef1a、Act-1基因可作为枸杞稳定的内参基因。
关键词:枸杞;内参基因;实时荧光定量PCR;定量分析
+
中图分类号:S567.190.1文献标志码:A文章编号:1002-1302(2023)09-0041-11
枸杞(Lycium)是茄科(Solanaceae)枸杞属研究较少,仅有少量枸杞基因功能和基因表达模式
(LyciumLinn.)多年生植物,具有抗旱、抗寒、耐盐分析的报道。关于枸杞内参基因筛选的报道的研
碱等特性,是改良土壤的先锋树种[1-3]。我国枸杞究材料多用黑果和宁杞1号[16-18]。目前尚未见有
资源较为丰富。近年来,宁夏农林科学院收集有国关不同基因型枸杞内参基因筛选的报道。
内外枸杞属10个种、3个变种以及特异性种质资源实时荧光定量PCR(real-timequantitative
2000余份,活体保存20000余株[4-5]。宁夏枸杞PCR,RT-qPCR)技术是在PCR反应体系中加入荧
(LyciumbarbarumL.)是我国药典收录的唯一枸杞光作为荧光探针,实时监测PCR反应进程荧光信号
[6]积累,并通过制作标准曲线计算待测样本相对表达
属植物。研究表明,枸杞多糖、甜菜碱、类胡萝卜
[19]
素、黄酮等是枸杞子中重要的功效物质,具有促进量的一种技术。它具有灵敏度高、重复性好、可
免疫、降低血糖、抗氧化、延缓衰老等生物活性[7-9]。检测大量样本且比常规RT-PCR检出率高等优
近年来从枸杞子中分离鉴定出枸杞亚精胺A-O,势[20-21],广泛应用于基因表达水平的分析。但在试
是一种具有抗阿尔茨海默病、抗氧化、抗衰老和神验操作过程中,RNA的质量和浓度、cDNA的逆转录
经保护作用的生物活性成分[10-12]。目前,枸杞的研过程、PCR的扩增程序和
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