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生物技术通报

·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2025,41（5）:320-332

短柄白黄侧耳CCMSSC04611基因组特异性分析

1，22221，3

吴泽银黄晨阳赵梦然张利姣姚方杰

（1.吉林农业大学园艺学院，长春130118；2.中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北方干旱半干旱耕地高效利用全国重点实验室，

北京100081；3.吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心，长春130118）

摘要：【目的】白黄侧耳菌株CCMSSC04611菌柄短粗，质地硬，菌盖颜色深，但其菌柄短的分子机制尚不清楚，对其进

行全基因组测序组装，并与长柄白黄侧耳基因组进行比较，分析其基因组构成、遗传变异及短柄形成的原因。【方法】提取白黄侧

耳CCMSSC04611的基因组DNA，通过对其形态特征及利用二代Illumina测序平台和三代pacbio测序平台进行基因组测序、组装和

注释分析，比较其与长柄白黄侧耳基因组的差异。【结果】CCMSSC04611二代测序获得原始测序数据为8.3Gb，过滤掉低质量序

列后约为8.29Gb纯净数据，三代测序和组装获得7.42Gb原始数据，过滤掉低质量序列后约为7.416Gb纯净数据，基因组GC含

量为50.85%，gap数量为0；二代和三代测序联合组装后，共获得23个1kb以上的contig，总长度为34635218bp。用二代测序

数据回比率和BUSCO评估对基因组组装质量进行评价，证实基因组组装结果比较可靠。预测获得的编码基因功能注释显示，共

9999个基因被注释，其中GO和KEGG数据库中分别注释到6331和3052个基因。与白黄侧耳CCMSSC00406基因组比较，两者共

有基因家族数量占比均达到98.33%以上；共有功能基因数占比高于83.97%；CCMSSC04611中特有基因家族数量为124个，特有

功能基因数为1618个，并且这些基因富集在细胞组分、催化活性、转录因子、蛋白质合成、MAPK信号转导等生物学过程中。

【结论】利用Illumina测序平台和pacbiorevio测序平台测序获得高质量的CCMSSC04611基因组参考数据，发现其与长柄白黄侧耳

CCMSSC00406基因组存在特有差异基因，为进一步研究CCMSSC04611的短柄形成的分子机制奠定了理论基础。

关键词：白黄侧耳；全基因组测序；功能注释；菌柄长度；比较基因组分析

DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2024-1137

Genome-specificAnalysisofPleurotuscornucopiaeCCMSSC04611

withShortStipe

1,22221,3

WUZe-yinHUANGChen-yangZHAOMeng-ranZHANGLi-jiaoYAOFang-jie

（1.CollegeofHorticulture,JilinAgriculturalUniversity,Changchun130118;2.TheInstituteofAgriculturalResourcesandRegionalPlanning,