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第16卷第17期食品安全质量检测学报Vol.16No.17
2025年9月JournalofFoodSafetyQualitySep.,2025
DOI:10.19812/ki.jfsq11-5956/ts.20250425003
引用格式:郑晓冰,潘南,陈婷茹,等.三疣梭子蟹原肌球蛋白抗原表位的生物信息学分析[J].食品安全质量检测学报,
2025,16(17):108–119.
ZHENGXB,PANN,CHENTR,etal.BioinformaticsanalysisofantigenepitopesoftropomyosininPortunustrituberculatus
[J].JournalofFoodSafetyQuality,2025,16(17):108–119.(inChinesewithEnglishabstract).
三疣梭子蟹原肌球蛋白抗原表位的
生物信息学分析
1,2223412*2*
郑晓冰,潘南,陈婷茹,李振兴,翁武银,黄文树,许旻,刘智禹
(1.集美大学水产学院,厦门361021;2.福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,
福建省海洋生物资源开发利用协同创新中心,厦门361013;3.中国海洋大学食品与工程学院,青岛266003;
4.集美大学海洋食品与生物工程学院,厦门361021)
摘要:目的研究三疣梭子蟹(Portunustrituberculatus)原肌球蛋白(tropomyosin,TM)Port4的理化性质、二
级结构、B细胞和T细胞的线性表位。方法利用生物信息学软件UniProt数据库、EXPASY、DNAstar软件、
SOPMA、ImmunomedicineGroup、ABCpred、IEDB、SYFPEITHI、NetMHCII和NetMHCIIpan在线工具分析
Port4的理化性质、蛋白二级结构并预测B细胞表位和T细胞表位。结果Port4为亲水性蛋白,二级结构以
23293646134136
α-螺旋为主,无复杂的空间结构,潜在的B细胞表位有NTLEQQN、AEKTEEEIRAT、SLS、
177184210218244246262267
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