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植物保护2PlantProtection
2024,50(2):144152
基于3种原噬菌体基因的赣南地区黄龙病菌
种群动态分析
王长宁，易龙*，马家钰
（赣南师范大学生命科学学院，赣州341000）
摘要柑橘黄龙病(citrusHuanglongbing,HLB)对全球柑橘产业造成了重大经济损失。为明确赣南地区柑橘黄龙
病菌基因组上原噬菌体的分子特征和传播动态，本研究对采自赣南10个市县区的470份样品进行HLB检测，并对
阳性样品中3种类型的原噬菌体（SC1、SC2和P-JXGC-3）上的SC1_gp050、SC2_gp040和PJXGC_gp08基因序列
进行遗传多样性分析和谱系地理学分析。结果显示，共检出74份HLB阳性样品，包括7种原噬菌体组合类型：
SC1,SC2、P-JXGC-3、SC1+SC2、SC1+P-JXGC-3、SC2+P-JXGC-3和SC1+SC2+P-JXGC-3，含SC2类型的原噬菌
体检出41份，检出率为55.41%，说明赣南地区含SC2类型的原噬菌体菌株最为普遍。遗传多样性分析结果表明，
赣南地区的3种原噬菌体的基因交流频繁，遗传分化现象不明显。选择压力分析结果显示，SC1和P-JXGC-3类型
的原噬菌体均处于负向选择,SC2类型的原噬菌体处于正向选择。基于3种原噬菌体上的基因构建的中介网络图
和单倍型分布表结果显示，3种原噬菌体均存在1个祖先单倍型，其他独有单倍型均是由该祖先单倍型经多次突变
而来，其中PJXGC_gpO8基因产生的独有单倍型最多。时空动态分析结果显示，SCl类型原噬菌体存在2条传播
路径，分别为安远和全南地区间的相互传播（3BF20），安远地区可能是SC1类型原噬菌体的主要扩散传播地。
P-JXGC-3类型原噬菌体存在3条传播路径，瑞金可能是P-JXGC-3类型原噬菌体的扩散中心。上述成果为解析柑
橘黄龙病菌亚洲种CandidatusLiberibacterasiaticus在赣南地区的遗传进化及扩散动态提供参考依据。
关键词柑橘黄龙病；原噬菌体；分子特征；传播动态
中图分类号：S436.66
文献标识码：ADOI：10.16688/j.zwbh.2023136
AnalysisofpopulationdynamicsofcitrusHuanglongbinginGannan
basedonthreeprophagegenes
WANGChangning，YILong*，MAJiayu
(SchoolofLifeSciences,GannanNormalUniversity,Ganzhou341000,China)
AbstractCitrusHuanglongbing(HLB)hascausedsignificanteconomiclossestotheglobalcitrusindustry.This
studyaimedtoelucidatethemolecularcharacteristicsandtransmissiondynamicsofprophagesregionongenomeof
pathogencausingcitrusHuanglongbingdiseaseinGannan.Atotalof470samplescollectedfromtencountiesand
urbanareasinGannanweretestedforHLB.ThesequencesofSC1_gp050,SC2_gp040andPJXGC-gp08genes
onthreetypesofproph
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