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生物信息学方法简介
（以下讲义来自北京大学生物信息中心）;;初级层面
基于现有的生物信息数据库和资源，利用成熟的生物信息学工具（专业网站、软件）解决生物信息学问题
——生物信息数据库（NCBI、EBI等）
——基因组序列分析、序列比对软件（GCG、BLAST、CLUSTAL等）
——系统发育树构造软件（PHYLIP、PALM、MEGA等）
——分子动力学模拟软件（GROMACS、NAMD等）
——搜集、整理有特色的生物信息学数据集;中级层面
利用数值计算方法、数理统计方法和相关的工具，研究生物信息学问题
——概率、数理统计基础
——科学计算基础
——现有的数理统计和科学计算工具（EXCEL、SPSS、SAS、MATLAB等）
——建立有特色的生物信息学数据库;高级层面
提出有重要意义的生物信息学问题；自主创新，发展新型方法，开发新型工具，引领生物信息学领域研究方向。
——面向生物学领域，解决生物学问题
——数学、物理、化学、计算科学等思想和方法
——建立模型，发展算法
——自行编程，开发软件，建立网页（Linux系统、C/C++、PERL、数据库技术）;第一式见龙在田;第二式飞龙在天;第三式鸿渐于陆;第四式或跃在渊;第五式羚羊触藩;权重矩阵分析方法举例;Bayesian打分函数用于剪接位点预测的公式;第六式潜龙勿用;第七式利涉大川;第八式神龙摆尾;第九式密云不雨;第十式突如其来;第十一式双龙取水;第十二式鱼跃于渊;——定性、经验的分类的局限
分类较粗、数据量小、凭借经验
——谱系聚类法（系统聚类法）、动态聚类法、模糊聚类法
——生物信息学中的聚类分析问题：
根据DNA芯片获得的基因表达数据进行基因聚类（数据量庞大）
蛋白质相互作用网络的分类
根据不同物种的大分子序列进行相似性比较并构建系统发育树;第十三式震惊百里;第十四式损则有孚;隐Markov模型
(HMM);第十五式时乘六龙;;第十六式龙战于野;第十七式履霜冰至;十七式合一亢龙有悔
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