第三章-DNA的结构与功能.pptVIP

第三章核酸的结构与功能

——DNA和RNA;;一、基本单元——核苷酸;嘌呤;二、核酸的一级结构和二级结构;2、核酸的二级结构，是由碱基对氢键维系的结构。;;A型B型Z型

外形粗短适中细长

螺旋方向右手右手左手

轴与碱基对的倾角不穿过穿过穿过

碱基对碱基对碱基对

大沟很狭，很宽，平坦

很深较深

小沟很宽、狭、深较狭、

浅很深;Nucleosome;DNA和蛋白质的相互作用;DNA与蛋白质相互作用是基因表达调控的分子基础。

生物体在发育过程中或应答外界环境刺激时，蛋白质（如转录因子）与DNA（调控元件）相互作用起着调控基因开关的作用。

这些蛋白质直接或者与其他蛋白质结合后间接识别靶基因DNA的特定位点，并且特异地同靶基因的DNA特定位点结合（一般8～12bp核心序列），参与基因组DNA的复制和转录调控。这种识别是通过蛋白质和不同的DNA结合来实现的。;（一）DNA与蛋白质的相互作用的主要类型

（1）螺旋—转角—螺旋

（2）亮氨酸拉链

（3）锌指蛋白区域

（4）螺旋-环-螺旋

（5）碱性α-螺旋

（6）β-折叠

（7）同源异形盒顺序

（8）同源域蛋白;;*;（2）亮氨酸拉链

亮氨酸拉链出现在许多真核基因中。它存在于蛋白质中，位于DNA结合域附近。1个亮氨酸重复形成的α-螺旋与另一个蛋白质的α-螺旋可形成一个盘绕或是拉链结构。这两条链通过亮氨酸间的疏水作用连在一起。在它们结合形成的Y型结构中，每一个臂（一个α-螺旋）可以与DNA大沟上某个特定的主要部分成键。

由两条相同或不同的肽段上两个α螺旋（helix）组成的卷曲螺旋（coil），由一系列间隔7个氨基酸的亮氨酸残基靠疏水作用形成，端部的两个α螺旋由leucinezipper将其插入DNA的两个大槽内。含leucinezipper调节蛋白在正常细胞中行使重要功能，其也在一些非调节蛋白中存在。Leucinezipper可将含helix-turn-helix和zincfinger的调节蛋白连接在一起。;*;（3）锌指蛋白区域

锌指蛋白区域出现在许多DNA结合蛋白中。它包含一个与锌原子结合的α-螺旋。在蛋白质中，这种结构可以多次重复，例如，一条α-螺旋和一个β折叠片可以通过锌原子连接。在许多时候，这种结构以α-螺旋和DNA大沟相互作用的方式存在，形成一个很强的特殊的相互作用。另外一种锌指结构是有两条α-螺旋通过与DNA大沟相互作用形成的二聚物的形式，与螺旋-转角-螺旋结构非常类似。;由约30个氨基酸组成，含两个胱氨酸和两个组氨酸或有时是4个胱氨酸与锌原子构成四部分复合物将氨基酸链拉成指头状的环（loop），可伸展到DNA大槽上的碱基边缘产生相互作用。含锌指结构的调节蛋白通常有2-10个锌指，与相邻DNA区段相互作用。大约有200多种调节蛋白含锌指基序是最普遍的DNA结合结构，锌亦可稳定其它DNA结合蛋白。;锌指结构简图;;;*;（5）碱性α-螺旋

两个两性α-螺旋(每个约12-15氨基酸)，α-螺旋一些部位存在密集的碱性氨基酸，一侧是疏水氨基酸，利于形成二聚体。

（6）β-折叠

反平行β-折叠与DNA大沟结合，亦多数是二聚体。;（7）同源异形盒顺序

同源异形基因均有一同源异形盒顺序（homeoboxsequence），长约180核苷酸编码60个氨基酸，该区段折叠成同源异形域（homeodomain）可识别并结合同源异形基因控制的所有基因的5’侧翼区。同源异形域含四个α螺旋，第2、3螺旋形成helix-turn-helix基序结合到DNA上8个碱基组成的八聚体顺序（octamersequence）由第3螺旋插入DNA上。;;蛋白质与DNA结合的特性;DNA和蛋白质相互作用的研究方法;2.DNA-蛋白质印记杂交;3.凝胶阻滞电泳;4.DNase1足迹法;5.DNA与蛋白质复合体的电镜观察;6.紫外交联法;7.干扰实验;8.染色质免疫沉淀