生物化学——蛋白质化学.pptVIP

第一章蛋白质化学;;;第一节蛋白质概述;一、蛋白质的概念;二、元素组成;三、蛋白质的基本组成单位;四、蛋白质的分类;第二节氨基酸的结构、分类和性质

;;二、20种普通氨基酸（commonaminoacids）的结构;非极性中性--脂肪族R基团;甘氨酸，Gly(G)

唯一无手性碳原子的氨基酸

无镜象立体异构体

直接和四个不相同的原子或原子团相连的碳原子;;;;;;;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;极性中性R基团;极性中性R基团;;;极性非带电R基团;极性非带电R基团;碱性氨基酸(带正电R基团);赖氨酸，Lysine，Lys（K)

侧链连接一个氨基，为碱性

氨基酸

EAA;精氨酸，Arg（R)

含胍基，

碱性氨基酸

;组氨酸，His（H)

含咪唑基，

碱性氨基酸

EAA;酸性氨基酸-带负电R基团;二）R侧链的特殊性及其作用;5）两Cys残基的巯基可以形成二硫键：对形成和稳定Protein的特定结构起着重要的作用。;;三、氨基酸的种类;;;N-甲酰蛋氨酸（N-Formylmethionine，fMet);selenocysteineandpyrrolysine,areincorporatedintoproteinsbyuniquesyntheticmechanisms.

SelenocysteineisincorporatedwhenthemRNAbeingtranslatedincludesaSECISelement,whichcausestheUGAcodontoencodeselenocysteineinsteadofastopcodon.

Pyrrolysineisusedbysomemethanogenicarchaeainenzymesthattheyusetoproducemethane.ItiscodedforwiththecodonUAG,whichisnormallyastopcodoninotherorganisms.ThisUAGcodonisfollowedbyaPYLISdownstreamsequence.

N-Formylmethionine(fMet)isaproteinogenicaminoacid.Itisaderivativeoftheaminoacidmethionineinwhichaformylgrouphasbeenaddedtotheaminogroup;;胶原蛋白中;胶原蛋白中;肌球蛋白;凝血酶原;;四、氨基酸的理化性质;（一）两性解离和等电点;兼性离子形式;;酸性氨基酸的pI;;;3、氨基酸在不同pH溶液中的带电情况

溶液pHpI,氨基酸带正电荷，在电泳时向负极运动。

pH=pI，氨基酸所带总电荷为零，在电泳时不移动。

pHpI,氨基酸带负电荷，在电泳时向正极运动。

;（二）其他理化性质

;;4.茚三酮反应

;第三节蛋白质的结构;一、肽键和肽链;（一）肽键;2.肽键的刚性：肽键具有部分双键性质

酰胺氮（含）孤对电子和羰基产生共振相互作用，形成共振杂化体

;3.肽键平面（酰胺平面）

参与肽键的六个原子位于同一平面，不能自由转动,称为肽平面。

;（二）肽链（peptidechain）;方向性：N端（氨基端）和C端（羧基端）

氨基酸残基（aminoacidresidue

重复单位：N-Ca－C

肽链有形成氢键的倾向

;二、寡肽、多肽和蛋白质;谷胱甘肽(glutathione,GSH);Glu、Cys和Gly组成的三肽

Glu的?-羧基参与形成肽键

－SH为活性基团

;GSH过氧化物酶;;三、蛋白质的结构;;（一）一级结构（Primarystructure）;6－10;(二)二级结构(Secondarystructure);2、二级结构的主要类型;;（1）α－螺旋;结构要点;氨基酸残基R侧链在螺旋外侧;;（2）β-片层（β-折叠）（β-pleatedsheetstructure）;2～数个肽段平行或反向平行聚积在一起；

肽段之间走向可以相同或相反;相邻肽段之间经C=O与N—H间形成的氢键来维系；

氢键方向与肽链长轴方向相垂直；;

;每个肽段以Cα为旋转点

;（3）β－转角（β－turn）;（4）π-螺旋（π-helix）;（5）无规则卷曲（randomcoil）;3.模体（motif）;钙