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生物大分子

——fromthepointviewofmaterialscience邵正中复旦大学高分子科学系复旦大学先进材料实验室生物大分子的种类什么是生物材料？蛋白质的分类简单蛋白质：仅由氨基酸组成的蛋白质（核糖核酸酶，胰岛素等）结合蛋白质：由氨基酸和非氨基酸两部分组成，其非氨基酸部分通常是糖类、脂类、核酸及各种辅助因子等（血红蛋白，核蛋白等）化学结构分子外形的对称程度球状蛋白质：分子对称性佳，外形接近球状或椭球状，溶解度较好，能结晶纤维状蛋白质：分子对称性差，分子类似细棒或纤维；又可再分为可溶性（肌球蛋白、血纤维蛋白原等）和不溶性（胶原、角蛋白、丝素蛋白等）结合蛋白质蛋白质的基本结构蛋白质的基本组成——氨基酸氨基酸的分类侧链性质acidiclargehydrophobicbasicsmallhydrophobicpolarresiduesulphurcontainingalcoholicresidues谷氨酸Glu天冬氨酸Asp甲硫氨酸Met半胱氨酸Cys组氨酸His精氨酸Arg赖氨酸Lys天冬酰胺Asn谷酰胺Gln苯丙氨酸Phe亮氨酸Leu色氨酸Trp异亮氨酸Ile酪氨酸Tyr丝氨酸Ser苏氨酸Thr甘氨酸Gly丙氨酸Ala脯氨酸Pro缬氨酸Val被修饰的氨基酸氨基酸序列——蛋白质的一级结构多肽链组成的蛋白质是有方向的，惯例认为氨基端为多肽链的头，简称N端；相应地，羧基端为尾，简称C端卵清溶菌酶的一级结构蛋白质一级结构的重要性测定蛋白质中氨基酸顺序的意义：氨基酸顺序是决定蛋白质生物活性的分子基础（i.e.酶的活性部位及其作用机理的阐明）从某种意义上，氨基酸顺序将决定蛋白质的二级结构－构象和三级结构；而其与三级结构之间的相互关系的分析，更揭露了控制多肽链折叠的一些规律如果蛋白质具有生理活性的话，氨基酸顺序的异常可能导致其功能异常和疾病（i.e.镰刀形贫血症）氨基酸顺序指明该蛋白质的进化史（进化中的分子事件）蛋白质一级结构的测定方法蛋白质均一性的确定：分子量、荷电性、氨基酸组成、氨端和羧端残基、生物活性、结晶性等氨基酸顺序测定程序：蛋白质或肽链的氨基酸定量分析（有时也包括其他化学组成，如糖、核酸等的分析）肽链末端残基，包括N端基与C端基残基的测定肽链的专一性降解与碎片的分离纯化分别测定肽链与碎片的氨基酸顺序从已知肽的顺序，根据有交盖重叠顺序的碎片相联的原则，复现肽链或蛋白质的一级结构确定分子中二硫键的位置肽链的降解肽键和二面角两个氨基酸连接成的二肽。图中表示了?和?的定义：?代表绕C?－C单键的转动；?代表绕C?－N单键的转动肽键具有部分双键性质（0.132nm），不能自由旋转肽单位是刚性平面结构在肽单位上，C＝O与N－H或两个C?呈反式排布构象——蛋白质的二级结构?–螺旋?–helix的具体参数?–折叠平行和反平行?–折叠Hydrogenbondpatternsinbetasheets.Hereafour-stranded?–sheetisdrawnschematicallywhichcontainsthreeanti-parallelandoneparallelstrand.Hydrogenbondsareindicatedwithredlines(anti-parallelstrands)andgreenlines(parallelstrands)connectingthehydrogenandreceptoroxygen.?–转折（I型和II型）TurnsareclassifiedintoTypesaccordingtothe(?,?)anglesofthetwocentralresidues(residue2and3).ThemaintypesareTypeIandTypeIIwhichhavemirrorimagesinTypesIandII(becausethemirrorimagetypesrequirepositive(?,?)anglesthemostcommonresidueintheseturnsisGly).TheProresidueisverycommonin?-turns,asitalwayshasthecorrect?angl