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肠道菌群概述

1.1肠道菌群的构成与建立

人体肠道微生物组成庞大，约有1012-1014个菌落定植于消化道内，种类可达500-1000种[17]。按照生物学“门”水平分类，可分为拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、梭杆菌门（Fusobacteria）和疣微菌门（Verrucomicrobia），宏基因组数据分析显示，前四门可占肠道细菌总数的98%[18-19]，其中拟杆菌门和厚壁菌门在健康成人肠道内居于主导地位[20]。另外，还存在极少量真核生物、古细菌、真菌和病毒[21]。细菌的数量和组成在胃肠道的不同部位有所不同：升结肠段主要为专性厌氧菌，微生物数量最多，物种多样性较高，其次是回肠末端，回肠和空肠近端的微生物数量较少，以快速生长的兼性厌氧菌为主[22-23]。

肠道微生物是在出生时从母亲体内获得的，定量聚合酶链反应（polymerasechainreaction,qPCR）和16SrDNA测序方法表明，在胎盘、羊水和胎粪中存在细菌群落[24]，表明婴儿肠道微生物的定植可能从子宫开始。婴幼儿时期肠道微生物受分娩方式（阴道顺产、剖腹产）及喂养方式（母乳、配方奶粉）的影响快速繁殖，并与宿主同步发展[25-27]，在6-36月龄的生命期内菌群结构逐步趋于稳