基因序列解码与意义探究.pptVIP

第1页;基因组序列所包括的全部遗传信息是什么？;基因组序列注释（annotation）;功效性RNA基因的定位;ORF：每个编码蛋白的基因都含有ORF，它是由一系列密码子组成，通常以ATG开始，TAA、TGA、TAG结束。;成功寻找ORF(ORFscanning)的核心在于终止子在DNA序列中出现的频率。;高等真核生物DNA的ORF的阅读障碍：

存在大量的基因间序列（如人类基因组占62%）

很多基因含有内含子

因为多数外显子长度100个密码子，当读码延伸至内含子通常会遇到终止密码，难以判断读码的准确性;编码同一氨基酸的不同密码子称为同义密码，其差别仅在密码子的第3位碱基不同。

特定生物体的基因中并不是所有密码子的使用频率都是平等的。

如Leu的密码子有6个（TTA、TTG、CTT、CTC、CTA、CTG），在人类基因中，绝大多数Leu都是由CTG编码的，而且几乎不由CTA和TTA编码。

预期真正的外显子会体现出密码子偏爱，随机碱基序列却不会。;1、通过序列筛查定位基因之外显子-内含子边界;几乎所有基因（或操纵子）上游都有调控序列，它们与DNA结合蛋白作用，控制基因表达

最常用的与转录起始位点相关的数据库是真核启动子数据库(EukaryoticPromoterDatabase,EPD.://www.epd.unil.ch/);1)Kozak规则，即第一种A