南臺灣族群MxA 基因起動子之核苷酸序列分析之研究.pdfVIP

高雄師大學報 2011, 31, 1-15 南臺灣族群MxA 基因起動子之核苷酸 序列分析之研究 1 2 王惠亮 、巴子晨 摘 要 人類 MxA 蛋白質是干擾素誘導的蛋白質之一，具有對抗 influenz 病毒及其它 RNA 病毒的抗病毒性，故被認為在寄主對抗某些特定的病毒中，扮演重要的角色。MxA 蛋白 質已被確認其結構與功能和鼠科Mx1 蛋白質類似。一個共同的特性，是在某些器官中， MxA 蛋白質被干擾素-α 或干擾素-β 刺激反應而合成，基因表現的實驗也已顯示，MxA 基因起動子中，至少有一區域含有對干擾素有反應的類似干擾素刺激反應序列(interferon stimulated response element like sequence ；ISRE-like sequence) 。本實驗隨機選取了30 位 南台灣閩南人，進行MxA 基因起動子核苷酸序列分析。實驗結果顯示，MxA 基因起動子 無 TATA 盒子(TATA-box)和 CAAT 盒子(CAAT-box) ，但有一富含GC 核苷酸之區域。南 台灣閩南族群之MxA 基因起動子核苷酸序列與NCBI 基因庫(NCBI GenBank)中MxA 基 因起動子之核苷酸序列相同度為98% 。其中，在-2 nt (-2 位置之核苷酸)與-3 nt 間有一插 入 Guanylic acid(G)核苷酸，此位置恰位於一般所謂的起始子(initiator)區域內。在-32 nt 與-33 nt 之間插入的Guanylic acid(G)核苷酸，恰位於所推測的SP1 結合位置內。而-41 nt 位置缺失之 Cytidylic acid(C)核苷酸，恰緊鄰於 ISRE1 之下游一個核苷酸位置。在起動 子-89 nt 及-124 nt 位置上，則發現分別為G/T 與A/C 的對偶單核苷酸多型性。此兩個核 苷酸位置使用限制片斷長度多型性分析(restriction fragment length polymorphism assay ； RFLP assay) ，確認所屬的合子(zygote)種類。結果顯示 C/C 同型合子與G/G 同型合子， 彼此間顯示高度的關連性(P0.05) 。此外，兩個SNP 間亦顯示高度的關連性，所有30 個 個體中，其中在-124 nt 位置上具有Cytidylic acid (C)核苷酸有29 個個體。而在29 個個 體中，有28 個個體同時在-124 nt 位置上具有Cytidylic acid (C)核苷酸，和在-89 nt 位置 上有 Guanylic acid (G)核苷酸，其關連性達 96.6% (28/29) 。而在-89 nt 位置上具有 Thymidylic acid (T)核苷酸的 11 個個體中，有 9 個個體本身在-124 nt 位置上亦有 Adenylic acid (A)核苷酸，其關連性達81.8%(9/11) 。 關鍵字：MxA 基因、起動子、單核苷酸多型性、類似干擾素刺激反應序列、干擾素 投稿日期：民國 100 年9 月20 日；接受刊登日期100 年 12 月16 日 1 國立高雄師範大學生物科技系教授。 2 國立高雄師範大學生物科技系碩士。 2 高雄師大學報 第三十一期 Analysis of MxA gene Promoter from Southern Min Group of Southern Taiwanese