大豆GmWRI1a基因克隆及生物信息学分析.pdfVIP

第44卷第7期 东 北 农 业 大 学 学 报 447()：11-16 2013年7月 JournalofNortheastAgriculturalUniversity Jtdy2013 网络出版时间2013—7—1118：45：51 [URL]http：／／www．cnki．netk／ems／detail／23．1391．S．2013071l_1845．013．html 大豆GinWRIla基因克隆及生物信息学分析 王志坤，常健敏，李丹丹，李文滨 (东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室(农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室)，哈尔滨 150030) 摘 要：利用Phytozome数据库、NCBI网站等软件对大豆(Glycinem )基因纽中WRI1同源基因进行生物信息 学分析 ，发现大豆WRI1转录因子有2个拷贝，分布在第8和 15号染色体上。以大豆未成熟种子cDNA为模板，克 隆15号染色体WRI1转录因子的cDNA全长序列，命名为GmWRIla。应用生物学软件发现，GmWRIla蛋 白含有2 个AP2／EREBP结构域(60—225)。进化树分析表明，GmWRIla包含在第一个分支里，与AtWRI1距离较近，推断其 与AtWRI1属于同源基因，具有相似的功能。对与GmwRI1a蛋白存在相互作用的蛋白进行预测分析，发现与其相 互作用的蛋 白多数参与糖降解或质体脂肪酸合成，结果表明，GmWRlla转录因子可能在控制种子发育中时从糖到 油的碳流动中起重要作用。 关键词 ：大豆；GmWRIla基因；生物信息学；转录因子；含油量 中图分类号：$565．1 文献标志码：A 文章编号：1005—9369(2013)07—0011-06 王志坤，常健敏，李丹丹，等．大豆GmWRJ1a基因克隆及生物信息学分析 J【】．东北农业大学学报，2013，44(7)：11-16． WangZhikun．ChangJianmin，LiDandan，eta1．CloningandbioinformaticsanalysisofGmWRI1ainsoybean[J]．Journalof No~heastAgriculturalUniversitY,2013，44(7)：11-16．(inChinesewithEnglishabstract) Cloning and bioinformatics analysis ofGmWRI1a in soybean／WANG Zhikun，CHANGJianmin，LIDandan，LIWenbin(KeyLaboratoryofSoybeanBiologyinChinese Ministry ofEducation (KeyLaboratoryofSoybeanBiologyandBreeding／GeneticsofChinese AgricultureMinistry)，NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030，China) Abstract：BioinformaticsofWRI1homologsinsoybeangenomewasanalyzedusingPhytozome databaseandNCB1website．TwocopiesofsoybeanW RI1homologswerefoundtodistributeonchro- mosome8and15，respectively．Weclonedonegeneonchrosome15，andnamedGmWRf1a．GmWRI1ain soybeangenomehadtwoAP2，EREBP domains．PhylogeneticrelaUonsresultsshowedthatGmWRIlaand AtW Rl1hadtheclosestrelationship．Therefore．preserved thatGmWRI1agenewasa memberofa plan