PolyA，PolyU及双链复合物PolyA183;PolyU的拉曼光谱研究.pdfVIP

维普资讯 第27卷 ，第5期 光 谱 学 与 光 谱 分 析 Vo1．27，No．5，pp040—943 2007年 5月 SpectroscopyandSpectralAnalysis May，2007 PolyA，PolyU及双链复合物 PolyA ·PolyU的拉曼光谱研究 廖昱博 ，孟耀勇 ，雷浩东 ，王 英 1．华南师范大学光子中医学实验室，广东 广州 510631 2．中国科学院广州地球化学研究所，广东 广州 510640 摘 要 测试了PolyA，PolyU及其双链复合物 PolyA ·PolyU的拉曼光谱 ，研究了双链形成前后的光谱变 化。结果显示 ：(1)15℃下，在 pH 7．0的0．14mol·L- NaC1，1rnmol·L-Tris水溶液 中，PolyU， PolyA，PolyA ·PolyU分别以无规卷曲、A型单螺旋和A型双螺旋结构存在。后两种结构区别于前者的主 要光谱标志之一是有序结构在814cm-附近出现的拉曼峰。另一光谱标志则是 1100cm-附近的谱峰半高 宽的大小。PolyA，PolyA ·PolyU在该处有着相同的半高宽，而 PolyU在该处的谱峰则有明显的展宽。此 外，还发现 PolyA的有序程度不及 PolyA ·PolyU，这可以从(813±2)cm-与 1100cm-的峰强比推知； (2)PolyU，PolyA形成双螺旋复合物之后，多聚核苷酸碱基一碱基堆积力大为增强，主链构象变得更为有序 化，从而产生了明显的拉曼减色效应并伴随着相关谱带的频移。在这个过程中，PolyU链 比PolyA链所产生 的光谱变化更为显著。该研究表明，从这类实验结果中提取特征光谱标志有望实现基因芯片的拉曼光谱检 测 。 关键词 PolyA；PolyU；基因芯片；拉曼光谱 中图分类号：0657．1 文献标识码：A 文章编号：1000—0593(2007}05—0940—04 比之于荧光检测，激光拉曼光谱方法无需样品标记，能够提 引 言 供关于样品分子结构丰富的光谱信息，而且谱峰细锐，便于 识别，加之它几乎不受水溶液的干扰，特别适合于生物样品 PolyA和PolyU是人工合成的只含有一种碱基的特殊序 的检测 “ 。因此 ，激光拉曼光谱技术是一种很有前景的生 列的单链多聚核苷酸。在一定条件下，根据碱基摩尔比的不 物芯片检测方法。 同，它们能够形成双链螺旋 PolyA ·PolyU或三链螺旋 PolyU ·PolyA ·PolyU结构。研究这些人工合成的多聚核苷 1 材料与实验方法 酸的结构和物理性质已经成为认识天然核酸最有效的途径之 一 。 这不仅可以为具有相似碱基成分和碱基序列 的天然 PolyA，PolyU购自Pharmacia公司，使用前未做进一步 RNA以及寡核苷酸的结构和功能的分析提供有效的参考， 纯化。其他化学试剂均为国产分析纯，实验用水为三蒸水。 而且对基因转录的研究也有重要的意义。人们已在核酸热动 为了得到双螺旋核酸PolyA ·PolyU，根据文献[5]，将碱基 力学以及离子强度 [1]和温度[5 对多聚核苷酸单、双链结 摩尔比为 1：1的PolyA和PolyU混合溶于0．14mol·L 构稳定性的影响方面做了大量的工作。本研究利用拉曼