人类基因组计划及其研究进展.pdfVIP

人类基因组计划及其研究进展 一、教学目的： （五号宋体，加粗，段前1 行） 理解基因组的概念 了解人类基因组计划 了解基因组测序、作图方法 掌握各图谱的含义特点 了解现阶段人类基因组计划的主要成果 学会利用人类基因组研究的信息资源 二、教学重点： 什么是人类基因组计划 人类基因组作图与测序 人类基因组计划主要成果 人类基因组计划的延伸 三、教学难点： 遗传图谱，物理图谱，多态标记 四、教学方法： 多媒体投影仪 五、教学过程设计： 1.什么是人类基因组计划 1）基因组：基因组 (genome) 是指细胞或生物体的整套 DNA，对于细菌和噬菌体及动植物 病毒而言，它们的基因组是指单个染色体上所含的全部DNA，而二倍体及多倍体真核生物的 基因组是指维持单倍体最基本的一套染色体DNA。 2）人的基因组分为细胞核内的核基因组和线粒体的线粒体基因组。 人的线粒体基因组DNA 全长16569bp，为环形分子。线粒体的变异与癫痫、感觉神经性 耳聋、致死性新生儿肌病、非胰岛素依赖性糖尿病等疾病有关。 通常所说的基因组研究主要是指核基因组研究，人的基因组由22 条常染色体加上X、Y 性染色体的DNA 组成，大小约为2.9-3.2Gb (Gb，gigabase pair，十亿碱基对)。 人的体细胞除了成熟的红细胞以外，都具有一套完整的基因组DNA。 3）人类基因组计划 人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)于1990 年10 月1 日由美国科学家发起 并正式启动，它的总体目标是在15 年内（1990-2005）投入30 亿美元，完成人类基因组全 9 部24 条染色体的310 对核苷酸序列分析，并识别所有基因（3~4 万个）的位置。 4 ）人类基因组计划的具体目标 人类基因组作图（遗传图谱、物理图谱、转录图谱）及序列分析 基因克隆 基因组研究技术建立、创新与改进。 模式生物基因组的作图和测序。 信息系统的建立、信息的储存、处理以及相应软件的开发。 人类基因组计划相关的伦理、法律和社会问题（ESLI ）的研究。 2.人类基因组作图与测序 1）作图（Mapping）：将基因组分解为较易操作的小的结构区域，这个过程简称为作图。 2）遗传图谱—— 确定疾病相关基因在染色体上的相对位置 遗传图谱：通过子代中出现重组型的频率或交换值来确定基因间的连锁程度，即基 因在染色体上的相对位置与距离。 确定基因间连锁关系的方法是进行测交：双隐性纯合个体作为一方亲本与野生型进 行杂交，分析子代中出现重组型的频率。 3）遗传图 (genetics map) /遗传连锁图(genetic linkage map) ：通过计算连锁的遗传标 志之间的重组频率，确定它们的相对距离而绘制的图谱，距离单位为厘摩（centimorgan,cM）。 1%交换值为1cM，人类中这一图距大约相当于1,000 Kb (kilobase pair, 千碱基对)。 4）几种多态标记: （1）RFLPs （2）STR （3）SNPs 5）物理图谱（physical map） 物理图谱(physical map)是指一套经过排序的覆盖整个基因组的DNA 克隆，这些克隆之 间存在重叠，形成连续的排列，称作重叠群(contig)，用来指示这些克隆之间的重叠及距离 的参照物称作标记（marker）, 如限制性内切酶的酶切位点、基因、STSs、ESTs 等，标记 间的距离以物理长度为单位（如染色体显带技术显示的区带、核苷酸的数目等）。 物理图谱的特点：物理图谱除了图距单位与遗传图谱不同外，更重要的是物理图的构建 不需作大量杂交和子代性状的分析，而可用物理、化学技术直接确定标记在染色体上的位置， 因此更加精确。 6）DNA 序列图(sequence map) 序列图是人类基因组在分子水平上最高层次、最为详尽的物理图。人基因组DNA 连接起来总 长度可达1米，测定基因组全序列是基因组计划中最明确、最艰巨的任务。 目前在测序工作中仍主要采用Sanger 发明的 “双脱氧核糖核酸链末端终止法”进行测定。 其基本原理是：测序时以一条链为模板，在一条测序引物的引导下，会产生新的DNA 链并不 断延伸。在体系中加入一定比