从天然产物中筛选人类表皮生长因子受体2的抑制剂.docVIP

  从天然产物中筛选人类表皮生长因子受体 2 的抑制剂# 刘秀洁，贾少华，戴荣继，邓玉林，吕芳** 5 10 15 20 25 30 35 40 （北京理工大学生命学院，北京 100081） 摘要：通过分子对接的技术，从天然产物分子数据库中寻找人类表皮生长因子受体 2 的抑制 剂，并借助计算机虚拟筛选平台对人类表皮生长因子受体 2 的抑制剂结构特征进行了研究。 搭建 DS 虚拟筛选平台。选择人类表皮生长因子受体 2 的胞外域和激酶域分别作为靶点蛋白， 分别就其不同的构象，形成的相互作用力，以及在对接过程中重要的氨基酸进行了讨论。结 果表明，人类表皮生长因子受体 2 胞外域倾向与含有寡糖链的甾体类化合物结合，而人类表 皮生长因子受体 2 激酶域则较易与含有多个氧原子和不饱和键的化合物作用。 关键词：人类表皮生长因子受体 2；天然产物分子数据库；分子对接 中图分类号：R93 Screening human epidermal growth factor receptor-2 inhibitors from natural products LIU Xiujie, JIA Shaohua, DAI Rongji, DENG Yulin, LV Fang (School of Life Science,Beijing Institute of Technology, Beijing 100081) Abstract: Using the technology of molecular docking, the inhibitor structural features of human epidermal growth factor receptor-2 were studied by screening human epidermal growth factor receptor-2 inhibitors from natural products databases. DS virtual screening systems had been established. The extracellular region and kinase domain of HER2 were selected as target protein. Different conformations, interaction forces formed and important amino acids were discussed in the docking process. The result indicated that the extracellular region of HER2 was prone to combine steroids with oligosaccharide chain and the kinase domain of HER2 easily combined compounds with more oxygen atoms and unsaturated bond. Keywords: Human epidermal growth factor receptor-2; Natural products database; Molecular docking 0 引言 人类表皮生长因子受体 2(h,HER2)，定位于染色体 17q12-21.32 上，编码相对分子质 量为 185000 的跨膜受体样蛋白，为跨膜酪氨酸激酶受体，具有刺激生长的活性[1]。其中 人类表皮生长因子受体 2 受体基因在细胞生 长因子信号传导通路中以及控制正常细胞生长 与分裂中起着关键性作用。人类表皮生长因子受体 2 的过度表达是由人类表皮生长因子受体 2 基因扩增引起的，人类表皮生长因子受体 2 基因扩增引起人类表皮生长因子受体 2 基因转 录增加，导致人类表皮生长因子受体 2 信使 RNA 水平提高和人类表皮生长因子受体 2 受体 合成的持续增加及过度表达。最终通过与配体结合，激活信号传导，导致细胞不停地分裂、 生长[2]。人类表皮生长因子受体 2 是重要的乳腺癌预后判断因子，文献报道约 20%-30% 的乳腺癌患者有人类表皮生长因子受体 2 受体的过度表达或扩增[3]。因此寻找人类表皮生长 因子受体 2 的抑制剂是治疗乳腺癌的一个重要方向。 基金项目：高等学校博士学科点专项科研基金（新教师课题基金）（NO.20091101120045） 作者简介：刘秀洁，（1989-），女，硕士研究生，药物化学。 通信联系人：吕芳，（1975-），女，讲师，天然药物化学。E-mail: lvfangbeijing@163.com -1-