3种RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒RNA定量检测中的性能评价.pdfVIP

3种RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒RNA定量检测中的性能评价.pdf

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中华医院感染学杂志 2009年第 19卷第 22期 ·3027 · 论 著 3种 RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒 RNA 定量检测中的性能评价 张 磊 ,陆小军,应斌武 ,庄 杰,丁 柳 ,代 波,王 军,刘显中,林 立,宋兴勃 (四川大学华西医院实验医学科分子诊断室,四川 成都 610041) 摘要:目的 比较 3种方法对血清 HCVRNA的提取性能,并对其作方法学评价 ,揭示 RNA提取技术对 HCV RNA定量的影响。方法 使用QIAampViralRNAMiniKit(Q法),NucliSensminiMag系统(M法)和匹基 (PG) 丙型肝炎病毒定量试剂盒 自带 RNA提取方法(P法)进行血清 HCVRNA提取,实时荧光 RTPCR定量检测 ,对 77例临床血清标本进行了提取检测 ,同时设计 了方法学评价实验 ,从准确度 ,重复性 ,线性和灵敏度方面评价 3 种方法。结果 77例临床标本的M、Q和 P法阳性率分别是 85.7 、84.4 和36.3 ;25例共 同阳性标本 中,M 和 Q法的CT值分别 比P法平均低 7.5和 9.35,表现 出高于 P法 的提取效率和 RNA质量 ;M和 Q法 的标准变 异指数 (s.D.I.)绝对值均2,P法 S.D.I.绝对值2;M法平均 CV为 40.0 ,Q法为 71.0%,P法100.0 ; M法表现最佳的线性 (RO.99),M、Q和 P法 的最低检测限分别为 39.4、394和3943IU/ml。结论 从提取效率 和收获 RNA质量上 M和 Q法远远优于 P法 ,进一步方法性能表 明,M法为 HCVRNA定量最佳提取方法 ,而 P 法因其提取效率低、收获RNA质量差以及重复性不好,不适合临床HCVRNA定量试验。 关键词:RNA提取;HCVRNA定量;提取效率;RNA质量;CT值 中图分类号 :R446 文献标识码 :A 文章编号 :1005—4529(2009)22—3027—03 ThreeCommercialRNA ExtractionM ethodsinHepatitisC ViralLoadTest: TheirComparativeEvaluation ZHANG Lei,LU Xiao-jun,YING Bin-wu,ZHUANGJie,DING Liu,DAIBo,WANGJun, LIU Xian—zhong,LIN Li,SONG Xing-bo ( ChinaHospital,SichuanUniversity,Chengdu,Sichuan610041,China) Abstract:OBJECTIVEToperformacomparativevalidationonthreesystems:QIAampViralRNA MiniKit(Q), theNucliSensminiMAG extractionsystem (M ),thePG method (P),inanattemptto elucidatetheimpactof extractionmethodsonthequantitativeassayofHCV RNA inserum.METHODSA totalof77anti-HCV positive serum specimens submitted for hepatitis viralload determination were used.M ethod performance:accuracy, reproducib订ity,linearityandsensitivitywereevaluated.RESULTSIn 77serum specimens,theHCV RNA was detectedat85.7 ,84.4 and 36.3 in nucleicacid extractsprepared by themethodsM ,Q andP,

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