甘蔗乙烯受体基因Sc-ERS的克隆与序列分析.pdfVIP

广西农业科学 2010，41(10)：1036—1040 GuangxiA culturalSciences 甘蔗乙烯受体基因Sc一船 克隆与序列分析 魏源文，邓智年，黄诚梅，潘有强，吕维莉，李杨瑞 (广西作物遗传改 良生物技术重点开放实验室．南宁 530007) 摘要：根据已知乙烯受体基因的序列信息，设计1对简并引物和1对特异引物，对甘蔗叶片基因组DNA进行PCR扩增， 获得1个甘蔗乙烯受体基因(Sc—ERS)的片段 ，其大小为4310bp，包含1个 由5个外显子和4个内含子组成的4219bp大 小的完整编码区。Sc—ERs编码区与玉米乙烯受体ERS1基因(AY359578)、水稻乙烯受体ERS1基因(AY043031)编码区 的同源性分别为91．4％、61．6％；推导Sc—ERS编码的蛋白包含636个氨基酸残基 ，与玉米、水稻乙烯受体基因所编码蛋 白的氨基酸同源性分别为94．1％、89．4％。其推导蛋白结构分析结果显示，Sc—ERs编码的蛋白和玉米、水稻ERS1所编码 的蛋白相同，在N段保守区含有3个跨膜结构，并由3个跨膜结构、GAF结构、HisKA和HATPase — c组成功能域。核苷酸序 列分析和蛋白质结构分析结果表明，Sc—ERS3j~因属于ERS1基因。 关键词：甘蔗；乙烯受体基因；克隆；序列分析 中图分类号：$566．1 文献标识码：A 文章编号：1002—8l61(2010)1O一】036～05 CJ…loningann1sequenci●ngolnsugarcaneeth’y_lenerecepto·rgene (Sc．ER WEIYuan—wen，DENG Zhi—nian，HUANG Cheng-mei，PAN You-qiang， LtiW ei-li，LIYang-rui (GuangxiCropGenetichnprovementandBiotechnologyKeyLab，Nanning530007，China) Abstract：A pairofdegenerateprimersandapairofspecificprimersweredesignedbasedontheconservedse— quencesofplantethylenereceptorgenestoamplifythegenomicDNAofsugarcane．A 4310bpfragmentofsugarcaneethy- lenereceptorgenefSc—ER wasclonedcontainingtheentirecodingregionof4219bp，consistedoffiveextronsandfour introns．ThecodingregionofSc—ERSshowed91．4and61．6％ homologywithmaizeERS1fAY359578)andriceERS1 (AY043031)，respectively．ThededucedproteinofSc-ERSencoded636aminoacids，andshared94．1and89．4％ simi— laritywithmaizeandriceERSI，respectively．ThearchitectureofdeducedproteinanalysisindicatedthattheSc-ERScon— tainedthreetrans-membranestructuresattheconservedN end，similartomaizeandriceERS1．Thefunctionalr