灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析.pdfVIP

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林 业科学研究 2011,24(5):549~553 文章编号:1001—1498(201I)05-0549-05 灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析 李 永 ,田国忠 ,朴春根 ,郭民伟 ,林乐民 (1.中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,国家林业局森林保护学重点实验室,北京 100091; 2.中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091) 摘要 :实验应用PCR扩增、iPhyClassifer分析、序列同源性及系统发育分析等方法对海南省灰叶丛枝病病害进行了分 子检测及其病原的鉴定 、系统进化研究。iPhyClassifer结果显示 :灰叶丛枝病植原体为花生丛枝组 (16SrII组)16Sr Ⅱ.A成员。序列同源性分析结果表明:灰叶丛枝病植原体与16SrlI、16SrII—A成员同源性最高,如与花生丛枝病植 原体 16SrDNA的序列同源性为99.9%,rp基因为99.9%。基于 16SrRNA和 rp两基因构建的系统发育树显示 :灰 叶丛枝病植原体与花生丛枝病植原体、甘薯丛枝病植原体起源相同,且关系相当接近。根据以上结果,灰叶丛枝病 植原体归为花生丛枝组(16SrlI组)16SrII-A亚组,与CandidatusPhytoplasmaaustralasiae候选种相关。 关键词:灰叶丛枝病;植原体;分子鉴定;系统发育 中图分类号:s763 文献标识码:A TheM olecularIdentificationandPhylogenyofTephrosia W itches’一broom Phytoplasma L/Yong ‘TIAN Guo-zhong ,PIAOChun-gen ,GUO Min.wei,LIN Le.min , (1.ResearchInstituteofForestEcology,EnvironmentandProtection,ChineseAcademyofForestry;KeyLaboratoryofFomstProtection, StateForestryAdministration,Beijing 100091,China;2.ResearchInstituteofForestry,ChineseAcademyofForestry,Beijing 100091,China) Abstract:Thetephrosiawitches’一broom phytoplasmacollectedfrom Hainanprovincewasclassifiedand identified bysequencingtechniquesand iPhyClassifer.Theresultsofsequencingand homologuouscomparison withother phytoplasmasshowedthattephrosiawitches’broom phytoplasmashared99.9% similaritywithpeanutwitches’一 broom phytoplasmain 16SrRNA geneand99.9% in rp gene.Tephrosiawitches’一broom phytoplasmaaresorted intoPeanutwitches’一broomgroup(16SrⅡ),16SrI1一A,accordingtotheresultsofiPhyClassiferof16SrDNA, phylogeneticanalysisof16SrRNA andrpgene,whichisrelatedtoCa.Phytoplasmaaustralasiae. Keywords:Tephrosiawitches’一broom;phytoplasma;molecularidentification;phylogeny 植原体(Phytoplasma)为无细胞壁原核微生物, 和遗传进化保守的基因分析等方法 J。植原体也像 专性寄生于植物和昆虫。迄今 ,世界各地已统计有 其他原核生物一样 ,其核糖体 16

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