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福建农林大学学报(自然科学版) 第40卷 第4期
Journal0fFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2011年7月
番鸭 cDNA-AFLP体系的建立
吴 旭,严美姣,刘丽平,连森阳,傅星源,王光瑛,李 昂
(福建农林大学动物科学学院,福建 福州350002)
摘要:以番鸭脑垂体为材料,用Trizol法提取总RNA,用SupersciptII-RT合成第一链 eDNA,RNaseH和DNAPolymerase合
成第二链 cDNA,最后用EcoRI/Mse1分步酶切cDNA各2h,经T|连接酶合成双链eDNA,预扩增反应后产物稀释加 倍进
行选择性扩增反应.经 l%琼脂糖电泳及6%变性聚丙烯酰胺凝胶 电泳检测的结果显示,番鸭脑垂体总RNA的提取及
eDNAA·l 预扩增和选择性扩增的效果 良好.番鸭 eDNA-AFLP反应体系的建立为番鸭就巢的分子机理研究奠定了基础.
关键词:番鸭;eDNAA·FLP;体系建立
中圈分类号:$834.2 文献标识码:A ‘文章编号:1671-5470(2011)04-0379-05
EstablishmentofcDNA.AIiI analysissystem formuscovyduck
WUXu,YANMei~iao,LIULi-ping,LIANSen-yang,FUXing-yuan,WANGGuang-ying,LIAng
(CollegeofAnimalScience,FujJna AgriculturenadForestryUniversity,Fuzhou,Fujina350002,China)
Abstract:ThecDNAamplifiedfragmentleIIgtlIpolymorphism (cDNA-AFLP)analysissystemofmuscovyduckwasestablishde U-
singpituitarya8materials.ThefirstsinglestrandcDNAwasgaindethrou#thereversetranscripti011fromhtetotalRNA.Thesecond
strandcDNAWaSsynhtesizedbyusingRNaseHnadDNApolymeraseIDNA.Double-strnadde cDNAwasdigestde completelyafter
2hdigestionbyEcoRInadMseIstepbystep,nadllgatde totwoadaptersbyT4DNAligase.Thepre—amplificationdilutedto
40timesforselectiveamplification.Theresultsof1% agarosegeleelctrophoresisnad6%denaturingpolya~rylamidegelelectro-
phresis(PAGE)indicatde thathteRNAextraction,eDNA-AFLPpre-maplificationnadselect—maplificationbyaboveprocedures
wereeflective.TheeDNA-AFLP叭BlyBi8systemw鹳 establishdesuccessfully,whichprovidedplaftormformolecularmechanismof
broodinessofmuscovyduck.
Keywords:muscovyduck;cDNA-FLP;system estub lishmen
cDNA扩增片段长度多态性(cDNAamplifiedfragmentlengthpolymorphism,cDNA-AFLP)是一种基于
RNA指纹的基因表达谱的检测方法,可以用于分析不同条件下整个基因组的基因表达方式和功能,与基
于PCR的基因差异表达分析方法和DNA微排阵法相比,具有多态性丰富、稳定性高、假阳性低、灵敏度高
以及无需了解序列信息等优点[1].研究表明,c
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