30株鸡传染性支气管炎病毒标准株与分离株SJ基因的克隆及序列分析.pdfVIP

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2017-09-12 发布于湖北
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30株鸡传染性支气管炎病毒标准株与分离株SJ基因的克隆及序列分析.pdf

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2008年 2l卷6期西南农业学报 V0L21 Nn6 SouthwestChinaJournalofAgnculturalSciences 1733 文章编号：1001—4829(2008)06—1733—04 3O株鸡传染性支气管炎病毒标准株与分离株 S 基因的克隆及序列分析谢志勤，谢芝勋，吕华刚2 (1．广西兽医研究所，广西南宁 530001；2．宾夕法尼亚州州立大学动物诊断中心，美国PAl6802) 摘要：利用IBVS1基因特异性引物对30株 IBV毒株进行RT—PCR扩增，产物经纯化后进行测序，并利用DNAstraMe：lign软件分析S1基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列。结果表明，广西分离株GXIB／02与Mass41、Conn、Ark、PA、Del、JMK、H52参考株的核苷酸序列同源性和氨基酸序列同源性均较低，与美国8O年代分离的毒株MW34、hofle、call5、AustT株的序列同源性也很低。这一结果与血清学试验结果相吻合，说明广西分离株GX1B／02与当今流行的标准株以及过去流行的毒株都不相同，是一个新的变异株，由此推断广西已有不同血清型 1BV毒株存在，可能导致新的变异株流行。关键词：传染性支气管炎病毒；S1基因；RT-PCR；序列分析中图分类号：$858．31 文献标识码：A CloningandnucleotidesequencinganalysisoftheS1gene from 30infectiOUSbronchitisvirusstrainswith standard referenceandisolatestrains XIEZhi—qin ‘XIEZhi—xun ，LVHua，gang~ ， (1．GuangxiVeterinaryResearchInstitute，GuangxiNanning530001，China；2．AnimalDiagnosticLab．，PennsylvaniaStateUniversity， PA16802，USA) Abstract：Basedonthepublished1BVgenesequences，apairofspecificprimerswasdesignde andsynthesizedforamplificationoftheS1 genesIBV strains．Total30ofRNA extractorfrom IBV strainsincludingrefeienceandfieldisolatesstrainswereamplifiedbyreversetran— scriptionandpolymerasechainreaction(RT-PCR)．ThePCRproductswerepurifiedandthensequenced．S1genenucleotidesandpredicted aminoacidsweIeanalyzedusingDNAstarMegAlignsoftwrae．TheresultsrevealedthattheisolatestrainGXIB／02hadlessthan80％ similar- ityhomologywiththe7standardreferencestrainsMass41，Corm，Ark，PA，Del，JMK，H52anddomesticstrainsMW34，hotle，Cal15isolatde from Americain1980s．Theserum antibodyneutralizationtestandnucleotidesequencingnaalysisresultsdemonstratedthatGXIB／02straini— solat