及其转座子TN45的特征分析.pdfVIP

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2017-09-12 发布于重庆
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及其转座子TN45的特征分析.pdf

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第 43 卷　第 2 期 ( ) Vol. 43 No. 2 复旦学报自然科学版 2004 年 4 月 Journal of Fudan University (Natural Science) Apr. 2004 　　文章编号 (2004) 2 个棒状杆菌质粒 pXZ10142 和 pXZ10145. 1 及其转座子 TN45 的特征分析 1 1 1 1 2 1 1 任兆瑞 , 施少林 , 蒋晓兵 , 严维耀 , 雷呈祥 , 刘明秋 , 郑兆鑫 ( 1. 复旦大学生命科学学院遗传学研究所 ,遗传工程国家重点实验室 ,上海　200433 ; 2. 海军医学研究所 ,上海　200433) 摘　要 : 对 1 株棒状杆菌 1014 中分离到的2 个质粒pXZ10145. 1 和pXZ10142 进行了相互关系分析. 序列分析 ( ) 显示pXZ10142 源自 pXZ10145. 1. pXZ10145. 1 包括 6 个开放读码框 open reading frame , ORF ,其中 ORF1 编码 247 个氨基酸 ,经缺失分析是复制酶. 在 pXZ10145. 1 上发现 1 个转座子 TN45 ,转座子上有 CM R 基因和 TN P 基因. 一对颠倒重复序列 IR1a 和 IR1b 位于 pXZ10145. 1 和 pXZ10142 的交互处 ,两边是顺向重复序列 A TCTA G. 关键词 : 棒状杆菌 ; 质粒 ; pXZ10145. 1 ; pXZ10142 ; 转座子 Tn45 中图分类号: Q 939. 11 ; Q 782 　　文献标识码 : A 　　棒状杆菌是一类革兰氏阳性菌 ,除少部分是动物或植物病原体外 ,大都被广泛用于氨基酸和核苷酸的工业发酵生产. 近几年来 ,人们也尝试用基因工程方法来修饰棒状杆菌 ,例如克隆限速酶基因、去除反馈抑制或阻断代谢旁路以提高氨基酸的发酵产量 1 . 其中一个重要的方式是发展载体系统 ,如利用质粒、转座子克隆并表达基因等. 国内外已经分离到许多棒状杆菌质粒 ,依据其质粒大小、限制酶图谱、来源及相容性等 ,可分为 7 类2 ,代表质粒是 pCR1 , pCR2 , pCR3 , pCC1 , pBL1 , p HM1519 , p GA1. 国内也分离到质粒 pXZ10145. 1 3 、pXZ10142 4 和 pXZ608 5 等. 从棒状杆菌中分离到的转座因子主要有插入序列 IS3183 和 IS1249 6 ,复合转座子 Tn5432 7 和 Tn5564 8 等. pXZ10145. 1 和 pXZ10142 是从同一株棒状杆菌中分离到的 2 个质粒 ,其中pXZ10145. 1 大小 4. 9 kb , 抗氯霉素. pXZ10142 为隐蔽性质粒 , 大小 2. 4 kb. 对这 2 个质粒进行全序列测定 , 分析发现质粒 pXZ10145. 1 带有 1 个转座子 Tn45 ,切离后形成质粒 pXZ10142. 1 　材料与方法 1 . 1 　细菌和质粒实验中用到的细菌和质粒列于表 1. 1 . 2 　培养基和试剂