中国荷斯坦牛cxcr1 基因遗传多态性与体细胞评分的联系分析.pdfVIP

中国农业科学 2010,43(18):3848-3856 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.18.020 中国荷斯坦牛CXCR1基因遗传多态性 与体细胞评分的关联分析 1 1 1 1 1 1 1 2 陈仁金 ，杨章平 ，毛永江 ，陈 莹 ，常玲玲 ，吴海涛 ，施雪奎 ，周里根 ， 王建勇 2 3 3 ，尹召华 ，梁祥焕 1 2 3 （扬州大学动物科学与技术学院，江苏扬州 225009 ； 上海光明荷斯坦牧业有限公司，上海 200072 ； 扬州大学实验农牧场，江苏扬州 225009 ） 摘要： 【目的】研究中国荷斯坦奶牛 CXCR1 基因的多态性及其与体细胞评分（Somatic cell score, SCS） 的关系，寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记，加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自 30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛CXCR1基因进行多态性检测，利用最小二乘均数法对CRCR1基因的多态位点 与 SCS 进行相关分析，利用 PHASE 软件对 4 个多态位点进行单倍型分析。【结果】检测到 4 个 SNPs，在 5　侧翼 区发现了3个SNPs （-1830（A/G）、-1768（T/A）、-344（T/C）），在编码区783（C/A）位点为新发现的SNP。 -1830（A/G）位点 AA 基因型个体 SCS 极显著低于 AG 基因型个体（P ＜0.01），-1768（T/A）位点 TT 基因型个体 SCS 极显著低于 TA 基因型个体（P ＜0.01），-344（T/C）位点 TT 基因型个体 SCS 极显著低于 TC、CC 个体（P ＜ 0.01）。783（C/A）位点基因型个体的SCS差异不显著。单倍型Haplo2（ATTA）纯合基因型的SCS极显著低于Haplo1 （ATCA）、Haplo3（GACA）和Haplo4（GATA）单倍型纯合基因型（P ＜0.01）。【结论】-1830（A/G）位点AA基因 型、-1768（T/A）位点 TT 基因型和-344（T/C）位点 TT 基因型以及单倍型 Haplo2（ATTA）纯合体对中国荷斯坦 牛的SCS具有较大的遗传效应，可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选。 关键词：中国荷斯坦牛；CXCR1基因；PCR-SSCP；多态性；单倍型；体细胞评分 Genetic Polymorphism of CXCR1 Gene and Its Associations with Somatic Cell Score in Chinese Holstein 1 1 1 1 1 1 CHEN Ren-jin , YANG Zhang-ping , MAO Yong-jiang , CHEN-Ying , CHANG Ling-ling , WU Hai-tao , 1 2