中国先天性心脏病nkx2. 5 基因突变筛查及联系研究.pdfVIP

中国先天性心脏病nkx2. 5 基因突变筛查及联系研究.pdf

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维普资讯 2005年 10月 首 都 医 科 大 学 学 报 Oct.2005 第 26卷 第 5期 JournalofCapitalUniversityofMedicalSciences Vo1.26 No.5 中国先天性心脏病Nkx2.5基因突变筛查及关联研究 石 琳 申阿东 李晓峰 柏 松 关晓蕾 李仲智 (首都医科大学附属北京儿童 医院心脏 中心) 摘要 :目的 探讨 Nkx2.5基 因突变和单核苷酸多态性(SNPs)与 中国先天性心脏病 (CHD)患儿的相关性 。方法 应用聚 合酶链反应结合 DNA测序技术 ,对 110例 CHD患儿及 110例正常对照者的Nkx2.5基因外显子 1及其侧翼进行突变检 测 ,并对其 SNP进行基 因分型,分析单个位点的等位基因和基 因型频率是否与CHD有关 。结果 在 Nkx2.5基 因外显子 1 中,CHD组及对照组均未发现有任何突变位点,仅在 CHD组找到 1个新 的SNPs;这个新 的SNPs位于上游 63碱基 ,其基因 型频率在 VSD组及 TOF组和对照组之间的分布差异有统计学意义( =34.021,af=2,P0.O1; =15.233,df=2, P0.01),等位基 因频率在 VSD组及 TOF组和对照组之间的分布差异亦有统计学意义 ( =24,813,df=1,P0.01; y=7.146,df=1,P0.01)。结论 Nkx2.5基 因突变与中国先天性心脏病之间无相关 ,Nkx2.5基因上的SNP与中国先 天性心脏病中室间隔缺损和法洛 四联症之间存在显著的相关性 。 关键词 :先天性心脏病 ;聚合酶链反应 ;DNA序列分析 ;基因突变 ;单核苷酸多态性 中图分类号 :R541.1 M utationScreeningofNkx2.5GeneandAssociatedStudyinExon 1in ChinesewithCongenitalHeartDisease ShiLin,ShenAdong,LiXiaofeng,BaiSong,GuanXiaolei,LiZhongzhi (CenterofCardiology,BeijingChildren’sHospital,CapitalUniversityofMedicalSciences) ABSTRACT:Objective ToelucidateassociationandthemutationofNkx2.5geneinexon1inChinesepatientswithcongenital heartdisease(CHD),Methods Weselected110CHDpatientsand110normalsubjectsascontrolgroupfrom BeijingChildren’s Hospita1.Afteramplifyingtheexons1oftheNkx2,5genebypolymerasechainreaction(PCR),wepurifiedthePCRproductsand conductedthesequencing reaction,analyzedtheSNPsand mutation screening oftheexon 1oftheNkx2,5gene,investigate whetherornottheNkx2,5geneisrelatedwiththeCHD inChinesepopulation.Results Nomutationwasfoundintheexon1of theNkx2.5gene;howeveranewsinglenucleotidepolymorphism (SNPs)wasidentified,furthercarriedOUtacase—controlstudy, thereweresignificantdifferencesoftheallelebetween theventricularseptaldefectortetralogyofFallotpatientsand normal controls( =34.021,df=2,P0.O1; =15.233,df=2,P0.01),Therewerealsosignificantdiffer

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