猪带绦虫成虫烯醇酶基因的生物信息学分析.pdfVIP

贵州医药 2O11年 5月第 35卷第 5期 ·387 · · 论 著 · 猪带绦虫成虫烯醇酶基因的生物信息学分析 贵阳医学院多媒体形态学实验室(贵阳550004) 刘玉江 王 宇△ 黄 江△ 摘 要 目的 分析猪带绦虫成虫烯醇酶(enolase，TsENO)基因结构并预测其编码蛋白的结 构和功能 方法 利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCB1)和瑞士生物信息学研究所 的蛋 白分析专家系统 (ExPASY)中生物信息学分析工具，并结合其它分析软件 ，从获得猪带绦虫成虫 全长 cDNA质粒文库的表达序列标签(expressionsequeDeetag，EST)中识别 TsENO基 因，分析该基 因的结构并预测其编码的蛋白质的结构和功能特征 。结果 该基 因与亚洲带绦虫烯醇酶基 因的一致 性 为 98 ，相似性 为 99 ；全长 l725I，1)，编码 区为 202～1162bp，编码 320个氨 基酸 ，为全长基 因。 无各种亚细胞定位序列，预测该蛋 白为跨膜蚤 白，与吸虫属的进化关系较近 。结论 从猪带绦虫成虫 cDNA文库中筛选出烯醇酶基因，预测为跨膜蛋 白，可能具有较好的免疫诊断抗原应用前景。 关键词 猪带绦虫 烯醇酶 cDNA 生物信息学 Bioinformaticsanalysisforthestructureandfunctionofenolasefrom Taeniasolium LiuYujiang， WcltlgYu Huang1lung ．TheBasic’MedicalMorphologyE,rperirnentalCenterofGuiyangMeal— icalCollege，Guiyang 550004 China． Department )【々Parasitology，GuiyangM edicalCollege， Guiyang 550004，China． Abstract Ob．iective Toanalyzeandpredictthestructureandcharacteristicsofenolasebybioin— formaticsinordertOguidetheexperimentalresearchforitsbiologicalfunctionandapplication．Methods Byusingtheanalyzingtoolsofbioinformaticsrecognizeenolasefrom theTaeniasolium full——lengthcD—。 NA plasmidlibratoryandanalyzethegenestructure，SO astoanalyzeand predictphysical—chemical characteristics，topologicalstructure．ResultsThefullgenewas1725bp in length，itscodingregion was202 1l62，coding320aminoacids．Itwasacompletefulllengthgenecomparingwiththehomo loguesin (enBaQnk ． Theproteinhad notransmemhraneregion．Theprotein containsnotransmem— braneregionandsuhcellularlocationsequence．Thepredictedaminoacidsequenceshowed98 identi tyand99 similaritywiththatofenolasefrom Schistosomajaponicum．ConclusionThecDNA se quenceencodedenolasegeneisscreenedfrom cDNA libraryofadultTaeniasolium bybioinformatical nlelhod．Thestructureandcharacter Faeniasolium ofthegeneand pr