毛竹甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析.pdfVIP

第28卷 第 3期 经 济 林 研 究 Vo1．28 No．3 2010年 9月 Nonwood Forest Research Sep．2010 毛竹甘油醛一3一磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析 杨 洋1I。，张智俊 ，罗淑萍。 (1．浙江农林大学 亚热带森林培育技术国家重点实验室培育基地，浙江 临安 311300； 2．新疆农业大学，新疆 乌鲁木齐830052) 摘 要：为了分离毛竹抗逆相关基因，利用 RT-PCR和 RACE技术，从毛竹叶片中克隆出甘油醛一3一磷酸脱氢酶基 因PeGAPDH 的全长cDNA序列(GenBank登录号 GU356597)。该序列全长 1368：bp，完整阅读框 1013bp，编码一 个具有 337个氨基酸残基的蛋白。利用生物信息学软件对 PeGAPDH蛋白进行了分析，结果表明：PeGAPDH蛋白 分子量为36．643kDa，等电点为6．33；该蛋白含有 2个保守区，即N端的NAD 结合区和靠近C端的催化功能区。 PeGAPDH是一种亲水性、非分泌型蛋 白，定位于膜的表面，属于氧化还原酶系，主要在中间产物代谢和能量代谢中 起作用。蛋白质进化树的构建结果表明：PeGAPDH与水稻等禾本科植物来 自细胞质中的GAPDH蛋 白的亲缘关系 很近，同双子叶植物的GAPDH则相差较远。 关键词： 生物信息学 ；毛竹；甘油醛一3一磷酸脱氢酶；基因克隆 中图分类号： Q943．2；$795．7 文献标志码： A 文章编号： 1003--8981(201O)O3一O0O7一O7 Cloningandsequenceanalysisofglyceraldehyde-3一phosphatedehydrogenase geneinPhyllostachysedulis YANGYang ，ZHANGZhi-junI，LUOShu-ping (1_StateKeyLaboratoryCultivationBaseofSubtropicalSilviculture，ZhejiangAFUniversity， Lin’an311300，Zhejiang，China；2．Xi~iangAgriculturalUniversity，Urumuqi830052，XiNiang，China) Abstract：In orderto isolatestressresistancegene，a 1 368 bpcDNA sequenceofglyceraldehyde~3一phosphate dehydrogenasegene，named asPeGAPDH (GenBank accession number：GU356597)，wascloned from leafin PhyllostachysedulisbyusingRT-PCR andRACE techniques．Thegenewitha1013bpopenreadingframeencoded aproteinwith337amino-acidresidues．Theresultsofbioinformaticsanalysisshowedthattherelativemolecularmass ofPeGAPDH proteinwas36．643kDaandtheisoelectricpointwas6．33．Theproteinhadtwoconservedcentraldo— mains，theNAD+bendingsiteinN-terminalandthecatalyticdomainneartheC-termina1