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第 卷第 期 水 产 学 报 年 月 文章编号 鲂属鱼类线粒体基因组的比较及其系统发育分析 赖瑞芳 张秀杰 李艳和 吴俊颉 杨东辉 王卫民 华中农业大学水产学院农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室 农业部淡水生物繁育重点实验室湖北 武汉 信阳农林学院水产科学系河南 信阳 摘要 基于 中团头鲂线粒体基因组全序列和三角鲂厚颌鲂广东鲂的部分线粒体基 因组序列设计引物扩增出三角鲂厚颌鲂和广东鲂 种鱼线粒体基因组全序列同时对 种 鲂属鱼类线粒体基因组全序列进行了比较分析 结果表明 种鲂属鱼类线粒体基因组基因 排列顺序完全相同排列紧密均包含 个蛋白质编码基因 个 个 个非编 码控制区 区 和 个轻链复制起始区 区 除 和 个 在 链上编码 外其余的基因均在 链上编码 种鲂属线粒体基因组 个蛋白质编码基因中均呈现出 较强的 偏向性和碱基偏好 全序列比对结果显示共有 个变异位点其中非简约 性信息位点有 个 占总变异位点的 简约性信息位点有 个仅占总变异位点的 个 基因中只有 个存在种间变异共 个变异位点主要发生在 三 叶草结构的 和 臂环上 个蛋白质编码基因中共检测出 个变异位点这些变 异主要发生在密码子第三位 占总变异位点的 其中变异位点数最多的是 基因 达 个其次是 基因 个 因此 和 基因可作为备选的分子标记用于鲂 属群体间的遗传学研究 基于 种鲂属鱼类线粒体基因组全序列构建的树和树均显 示三角鲂与厚颌鲂的亲缘关系最近团头鲂与它们的亲缘关系相对较近而广东鲂与前述 种鲂属鱼类的亲缘关系均较远 关键词 鲂属 线粒体基因组 变异位点 分子标记 系统发育 中图分类号 文献标志码 在脊椎动物中线粒体基因组为双链闭合环 状分子长度为 与其他脊椎动物一 在 链上编码外其余的基因 样鱼类线粒体基因组核酸序列和组成比较保守 均在 链上编码 线粒体基因组具有信息 且排列紧密 根据碱性氯化铯密度梯度离心中 量丰富分子量小基因结构及排列简单多个拷 含量的高低将双链分为重链 链 和轻链 贝物种内几乎不发生重排无内含子母系遗传 链 它们绝大多数由 个蛋白质编码基 进化速率快等优点是一个相对独立的复制单位 因 和 是生物学家研究系统发育进化的有力工具也是 个核糖体 基因 惟一可以提供在基因组水平上进行研究的分子标 和