人类新基因MATH2的克隆、生物信息学分析及功能初步探讨.pdfVIP

人类新基因MATH2的克隆、生物信息学分析及功能初步探讨 作者:郭凌晨 导师:马晓军 (武汉大学生命科学学院，武汉430072) 摘 要 录因子是真核细胞中调控基因转录的蛋白质，鼠Math2和人的 4 VEUROD.NEUROD2均属于其中含有螺旋一环 能域的一类。此类转录 因子在神经系统的分化和发育上起重要作用 我们从胎脑 cDNA文库获得了一条长为 1344by的cDNA，该序列包含 一个完整的开放阅读框，编码337个氨基酸。因该多肚与鼠Math2蛋白有 98%的同源性，故将该 cDNA所对应的新基因命名为人MATH2。在与人的八 种组织mRNA进行Northern杂交结果中显示该基因只在人脑组织内表达， 在1.7kb和2.4kb处显示两条特异性条带。这个结果提示人MATH，可能 存在两种转录本。人AMTH2基因的生物信息学分析确定了该基因的全长为 2.175kb，定位于人染色体 7pl4-15，且在功能域结构上与其同源蛋白鼠 施th么 人八EUROD和NEUROD2有很大的相似性。在探询Nor七hernblot显 示的1.7kb条带来源的过程中，从人胎脑。DNA文库内发现一条长约1.0kb 的序列，此序列为人MATH2基因与人 hnRNPA2/B1基因发生遗传重组的产 物。结合生物信息学分析结果，我们对人MATH2的一些潜在功能进行了探 讨，进一步工作有待进行。 关键词:MATHZ)基因 转录因子bHLH定动生物信息学分析 Cloning,BioinformaticsAnalysesandCharacterizationof ANovelHumanGene,MATH2 Author:GuoLingchen,Advisor:MaXiacjun (CollegeofLifeSciences,WuhanUniversity,Wuhan430072,P.R.C.) Abstract Basic-helix-loop-helixfactorsplayanimportantroleinthedevelopment anddifferentiationofnervoussystem.MouseMath2, humanNEURODand NEUROD2areallbelongtothefamily. WegotacDNAof1344byrfomhumanfetalcDNAlibrary.Thesequence containsacompleteORFandencodesapeptideof337aminoacidresidues.The homologyofthegenewhichthecDNAliesandmouseMath2is98%,sowe namedthegenehumanMATH2.TheresultofNorthernBlotofhumanMATH2 withothereighthumantissuesdemonstratedthatitspecificallyexpressesin humanbrainandappearedtwobandswiththesizeof1.7kband2.4kb.That suggeststhathumanMATH2mayhastwodifferenttranscript.Accordingtoa seriesofbioinformaticanalysesofthegene,weascertainedthatitswholelength is2.175kbanditslocationofhumanchromosome7p14-15,aswellasitshigh similaritytothemouseMath2,humanNEURODandNEUROD2instructure Duringtheprocessofsearchingfortheoriginofthe1.7kbbandfromthe Northernblotresult,wefounda1.0kbchimericcDNAofhumangeneMATH2 andhnPNPA2/Bl.Refertoth