近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AEB’重组病毒基因.pdfVIP

诊断学理论与实践 2008年第 7卷第 5期 · 511· · 论 著 · 近全长序列分析 HIV．1独特型 CRF01AE／B’重组病毒基因 一 杨 洋 ， 周磊明 ：， 薛以乐 ， 潘启超 ， 康来仪 ， 戚中田 ， 钟 平 (1．第二军医大学微生物教研室 上海市医学生物防护重点实验室，上海 200433； 2．上海市疾病预防控制中心艾滋病性病科 上海市艾滋病研究中心 ，上海 200336) [摘要] 目的：对上海市发现的 1例独特类型的CRF01一AEB／’重组病毒株进行近全长序列分析 ，以了解其 DNA 序列的特征 ?方法：应用巢式逆转录聚合酶链反应 (RT—PCR)方法 ，分段扩增 HIV一1近全长基因组相应片段 ，进行克 隆、测序 ．并分析其遗传进化树和序列断点位置。结果 ：近全长序列分析提示 ，该患者所感染的病毒由CRF01一AE和 HIV一1B’亚型嵌合组成 ，两者各 占约 5O％：其多聚酶蛋 白基因(P0f)和外膜糖蛋白基 因(Env)区均有 HIV．1B’亚型片段 和 CRF01AE片段嵌合组成 ：2种亚型病毒 DNA片段嵌合点的位置与过去报道 的重组病毒株 (CRF15一AE／B、 一 CRF33 AE／B和 CRF34AE／B)均不同：结论 ：在我 国常见流行 的HIV．．CRF01一AE重组病毒与B’亚型已在HIV—l感 一 一 染人群中发生重组，其可能是在我国散发流行的独特型重组病毒株。 关键词 ：人免疫缺陷病毒 I型： 基 因亚型 ： 重组 ： 近全长序列分析 中图分类号 ：R5l2．91 文献标识码 ：A 文章编号 ：1671—2870(2008)05一O511—06 Nearfull—length sequenceanalysisofauniqueCRF01 一 AE／B’recombinantexistedinShanghai YANGrand， ZHOULei—mind,XUEYi—le2R4NQi—chao2~K4NGLai—yi2,QIZhong-tian!，ZHONGRn ．1．DepartmentofMicrobiology, SecondMilitar~MedicalUniversit)，Shanghai]IunicipalMedico]Bio-defenseKeyLaborcaor)，Shanghai200433，China； 2．DepartmentofAIDS／STD．ShanghaiMunicipalCenterforDiseaseControl＆Prevention．ShanghaiMunicipalCenterfor AIDSResearch，Shanghai 200336,China [Abstract] 0bjective Tonlakeanear