真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2012 5 , 34(5): 635―646 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2012.00635 真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11 基因家族生物信 息学研究 1,2 2 2 2 2 2 2 2 2 张昕 , 姜华 , 王艳丽 , 张震 , 毛雪琴 , 柴荣耀 , 邱海萍 , 杜新法 , 王教瑜 , 孙国昌2 1. , 310036; 2. - , , 310021 PEX11 基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子, 文章利用生物信息学方法对 26 种代表 性真菌的 PEX11 基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现：(1)26 种真菌中共有 66 个可能的 PEX11p 。 酵母类真菌有 1 个或 2 个 PEX11p, 而大多数丝状真菌中包含 2 到 3 个, 其中子囊菌中 PEX11p 的个数偏多, 个 别种类达到 5 个; (2)真菌 PEX11p 可分为 3 类, 大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的 PEX11p, 类型Ⅱ是盘菌亚门 真菌所特有的, 可能与类型Ⅰ和类型Ⅲ在功能上有冗余; (3)通过 MEME 分析, 发现 PEX11p 含有多个保守区域, 其中 C 末端的 Motif8 具有很高的保守性, 推测可能对 PEX11p 发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌 PEX11p 的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。 真菌; 过氧化物酶体; PEX11 基因家族; 生物信息学; 进化分析 Bioinformaticresearch of the family of PEX11, peroxisomeprolifer- ous factor in fungus 1,2 2 2 2 2 ZHANG Xin , JIANG Hua , WANG Yan-Li , ZHANG Zhen , MAO Xue-Qin , CHAI 2 2 2 2 2 Rong-Yao , QIU Hai-Ping , DU Xin-Fa , WANG Jiao-Yu , SUN Guo-Chang 1.College of Life and Environment Sciences, Hangzhou Normal University, Hangzhou 310036, China; 2. State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Institute of Plant Protection Microbiology , Zhejiang Academy of Agricultural sciences, Hangzhou 310021, China Abstract: The family members of PEX11 are key factors involved in regulation of peroxisome proliferation. Sixty-six PEX11p candidates of PEX11 gene family from26 representative fu