高通量转录组测序的数据分析与基因发掘.pdfVIP

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2017-09-02 发布于重庆
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高通量转录组测序的数据分析与基因发掘.pdf

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30 5 Vol． 30 No． 5 第卷第期江西科学 20 12 10 Oct． 20 12 年月 JIANGXI SCIENCE 文章编号:1001 － 3679 (2012)05 － 0607 － 05 高通量转录组测序的数据分析与基因发掘 1 2 1 1* ，，，周华张新刘腾云余发新 (1．，， 330029 ; 江西省科学院生物资源研究所江西省观赏植物遗传改良重点实验室江西南昌 2 ．， 210036) 南京市林业站江苏南京 : (RNA-seq) ，摘要高通量转录组测序是在转录组水平上进行深度测序的一项技术为真核生物转录组学的研，。究开创了新平台但同时测序所得到的海量数据的生物信息学分析成为科研工作者的一大挑战对转录组测，，序技术进行了阐述重点介绍了转录组测序后的数据分析以及在真核生物尤其是非模式物种中的基因发掘方法。 : ; ; 关键词转录组测序数据分析基因发掘中图分类号:Q987 文献标识码:A Data Processing and Gene Discovery of High-throughput Transcriptome Sequencing ZHOU Hua1 ，ZHANG Xin2 ，LIU Teng-yun1 ，YU Fa-xin1* (1． The Biology Institute ，Jiangxi Academy of Sciences ， Horticultural Plant Genetic Improvement Key Lab ，Jiangxi Nanchang 330029 PRC ; 2 ． Nanjing Forestry Bureau ，Jiangsu Nanjing 210036 PRC) Abstract :High-throughput transcriptome sequencing (RNA-seq)is a recently developed approach to transcriptome profiling that uses deep-sequencing technologies． It provided a novel platform for eu- karyotic transcripome researches ，but the bioinformatics analysis of sequencin