人乳头瘤病毒16型E5序列进化分析.pdfVIP

塞蝗 床病毒学杂声 2009年12月第23卷第6期 ChineseJExpClinVirol，December2009，V01．23，N。．6 ． 论 著 ． 人乳头瘤病毒 16型E5序列进化分析 郝敏 ，吴晓舟，王晓莉 ，卞关璐 ，刘宏 图 【摘要】 目的 通过HPVl6E5序列进化分析，初步研究 中日友好医院妇产科宫颈病变诊治中 心无宫颈病变的汉族妇女 HPV16型 内变异株类型。方法 用 PCR法扩增 HPV16E5基 因片段 ，并进 行比对分析测序。比对后的结果结合临床资料进行分析。结果 本研究第一次利用只有 236bp碱 基的E5序列进行 HPV16变异株的进化分析 ，发现单独使用 E5序列进行 HPV16变异株进化分析 的 准确率很高，并且 ，本研究第一次发现 以4075T即可将亚洲株 (As)变异株和其他变异株 区分开来 。 结论 从 E5基因序列出发进行进化分析，准确率高。单独 以4075T即可将 As变异株和其他变异株 区分开来 。 【主题词】 乳头状瘤病毒，人； 变异(遗传学)； 序列分析 Humanpapfllomavirustype16E5sequenceevolutionanalysis 矾 OMin ，WUXiao-zhou，WANGXiao-li， BIANMei-lu， Hong-tu． GraduateSchoolofPekingUnionMedicalCollege，Beijing100730，China Correspondingauthor：BIAN Mei-2U，Emaif：bianmeilu@ ho tmail．corn ；L1U Hong-tu，Emaif：hotliu@ gmail．con 【Abstract】 Objective ToinvestigatethedistributionofHPV16variantsinHanwomenpatientswithout Cervicalintraepithelialneoplasiainthediagnosisandtreatmentcenterforcervica1disease，departmentofObstetriCS andGynecologyinChina—JapanfriendshiphospitalwithHPV 16E5sequencephylogeneticanalysis．Methods PCR amplification ofHPV 16E5sequencesand sequenced． eassociationbetweenvariationstypesanddifferent cerqieallesionswasanalyzed．Results Inthisresearch．W efirstfoundthatvariantclassificationbasedon lipV 16E5DNAsequence(236bp)alonehadhighrateofaccuracy．Inaddition，f0rthefirsttime，ourresearch revcaled thatsingle一4075T candistinguishedtlleAsvariantfrom allothervariants．Conclusion IfE5 sequence wasusedforphylogeneticanalysis，itwillgreatlyreducetheexperimental costsandimproveefficiencyandcost— effectiveness．Forthefirsttime，ourresearchrevealedthatsingle4075TcandistinugishedtheAsvariantrfom all othervariants． 【Keywords】 Papillomavims，human； Variantion(Genetics)； Sequenceanalysis 人乳头瘤病毒 16型 (Humanpapillomavirustype 注 ，近几年的许多研究认为不同的HPV16型内变异 16，HPV16)是人乳头瘤病毒阿尔法属第九种的代表 株有不同的致癌性。目前 ，