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NN表达情况及该基因与肿瘤的关系。
f实验材料
1.人肝cDNA
2.外显子捕获系统
3.基因克隆相关分子生物学试剂
4.Northern杂交及RT—PCR相关试剂
5.正常组织及肿瘤组织
实验方法
利用捕获的外显子进行BLAST同源性分析,之后采用外显子
拼接技术克隆新基因,利用RT—PCR及Northern印迹杂交检测该
基因的组织表达情况,同时以B—actin作内对照。
结 果
利用外显子HC8exBl3,exBl0,exBl8拼接成一个开放阅读框
架为510bp的序列,BLASTN同源性分析可知与推测基因
AK024799相似(510/510)。关于推测基因的定位、结构和功能均
未报道,因此对其进行特性分析,该基因cDNA全长2.8kb,跨越
基组DNA8kb,其编码的蛋白质有454个氨基酸,含有一个SH:结
构域,因此称该基因为SH:A(SH:alone),定位于8p22。编码的蛋
白质分子量57,726道尔顿,等电点为8.09。sH,A基因产物作为
SH:信号蛋白家族的新成员,在酪氨酸蛋白激酶相关受体介导的
信号传导中起一种接头蛋白的作用。
RT-PCR及Northern印迹杂交发现SH,A在多种组织中有表
·2·
达,有3个转录本,而且在癌及癌旁组织的比较中发现,肿瘤组织
中表达较高,初步证明与肿瘤的发生有关。
讨 论
1.SH,A基因的结构分析和组织表达
利用外显子HC8
架为510bp的序列,BLASTN同源性分析可知与推测基因
内含子组成,编码的蛋白质有454个氨基酸,含有一个SH:结构
质分子量57,726道尔顿,等电点为8.09。
sH2A是sH:信号蛋白家族的新成员,在酪氨酸蛋白激酶相
关受体介导的信号传导中起一种接头蛋白的作用。而且RT—PCR
及Northern印迹杂交发现SH:A在多种组织中有表达,有3个转录
本,大小为2.8kb、i.8kb和1.3kb。
2.SH,结构域信号蛋白
homology
SH,(see 2)结构域是由100个氨基酸组成的保守序
列,在许多细胞内信号蛋白中发现了相似序列,它们因与Src基因
表达产物Sre蛋白有相应的结构域而得名。具有SH:结构域的蛋
白质构成了一类蛋白质家族,在酪氨酸蛋白激酶相关受体介导的
信号转导过程中起枢纽作用,有学者将SH:结构域视为”蛋白质
识别密码”,表示它控制和预测蛋白质-蛋白质的相互作用。因此
sH:A基因产物作为SH:蛋白家族新成员,在信号传导中发挥作
用。
3.SH,A与肿瘤的关系
酪氨酸残基的磷酸化是SH:结构域行使功能的先决条件,而
酪氨酸激酶和磷酸酶同时受磷酸化调节,因此SH:可介导激酶活
·3·
性也可介导磷酸酶活性,有人认为激酶活动性升高与肿瘤发生相
关而磷酸酶的活动性升高可以抑制肿瘤产生,因此它们的结合才
产生协调的生命活动。
s心家族蛋白的过表达可以使胞质中酪氨酸激酶活性增强,
也可以抑制酪氨酸磷酸酶的活性,最终造成细胞增生甚至肿瘤发
生。我们选择了几例不同癌组织和癌旁组织,应用RT—PCR和
Northern印记杂交进行了sH:A表达的定量分析,其结果显示5/7
癌组织sH:A基因表达有明显增加,初步证明与与肿瘤发生有一
定关系,因此必须进一步扩大病例来阐明SH:A基因与肿瘤的关
系。
小 结
人类基因组计划完成之后,已进入后基因组学阶段,疾病基因
的定位克隆已成为研究的重要内容。外显子捕获是在易感位点分
离疾病候选基因的重要途径之一。因此利用外显子捕获及外显子
拼接技术,在8p22区域得到一个510bp序列,序列比较分析可知
与推测基因AK024799某一段完全相似。通过对该基因的结构和
而且仅有一个sH:结构域,因此称这个新基因为SH:A,定位于
8p22。它的产物作为sH:信号蛋白家族的新成员,在酪氨酸蛋白
激酶相关受体介导的信号传导中起作用;利用RT.PCR及Northern
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