生物医学文献知识发现研究探讨及展望.pdfVIP

第l 卷第3 期 复 杂 系 统 与 复 杂 性 科 学 VoI. l No. 3 2004 年 7 月 COMPLEX SYSTEMS AND COMPLEXITY SCIENCE JuI. 2004 文章编号：l672 - 38l3（2004 ）03 - 0045 - ll 生物医学文献知识发现研究探讨及展望 l l 2 周雪忠 ，吴朝晖 ，刘保延 （l. 浙江大学计算机学院，浙江 杭州3l0027 ；2 . 中国中医研究院，北京 l00700 ） 摘要：采用文本挖掘技术处理海量生物医学科技文献和文本注释型数据库，从而发现创新知识 如基因、蛋白质、疾病、药物及其相互关系的研究是当前人工智能和数据挖掘领域研究的热点。 本文对生物医学文献知识发现的研究内容、研究成果以及基于文本挖掘的关键技术诸方面进行 了系统的分析和阐述。通过分析中医药学数据的特点，提出了基于文本挖掘的中医证候分子生 物学知识发现研究，该方法的特点是综合利用中医药学文献和MEDLINE ，能够获得创新的证候 与基因相关知识。初步实验表明，文本挖掘技术有望为证候的分子水平研究提供辅助和支撑手 段。 关键词：文本挖掘；文献知识发现；生物医学；中医药 中图分类号： TP39 ；R2 ；@7 文献标识码：A Knowledge Discovery in Biomedical Literature ：Survey and Prospect l l 2 ZHOU Xue-zhong ，WU Zhao-hui ，LIU Bao-yan （l. CoIIege of Computer Science ，Zhejiang University ，Hangzhou 3l0027 ，China ； 2 . China Academy of TraditionaI Chinese Medicine ，Beijing l00700 ，China ） Abstract ：Using text mining methods to process huge biomedicaI Iiterature and text annotation databases for discovery of noveI scientific knowIedge such as gene，protein ，disease ，drug and the reIationship among them ，has been the foci in arti- ficiaI inteIIigence and data mining research fieIds. The Iatest researches of biomedicaI Iiterature knowIedge discovery ，incIu- ding main issues ，accompIishment ，and the key methods from text mining perspective ，are discussed. Furthermore ，this paper proposes a text m