人Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测.pdfVIP

杨 霞等 人 Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位预测 第 l期 · 37 · 生殖免疫学 · 人 Izumo蛋 白的二级结构及 B细胞抗原表位预测① 杨 霞 刘凯军② 申子刚 何海洋 张 记 张巧玉③ 吴玉章 李晋涛 (第三军医大学全军免疫学研究所，重庆 400038) 中国图书分类号 R392．11 文献标识码 A 文章编号 1000-484X(2010)O1．0037-04 [摘 要] 目的：预测人 Izumo蛋白的二级结构及B细胞抗原表位。方法：以人 Izumo基因序列为基础，按Chou-Fasman和 Gamier-Robson方法预测其编码蛋白的二级结构 ，采用Karplns—Schulz方法预测 Izurllo蛋白骨架区的柔韧性；按 Kyte-Doolittle方法 预测其亲水性 、Emini方法预测蛋白质表面可能性及 Jameson-Wolf方法预测抗原性指数。结果：Chou-Fasman及Gamier-Robson两 种方法预测的结果均表明，Izumo蛋白含较多的 螺旋，蛋 白第6—17、30～40、88—99、103～120、153 160、173～188、249～26O、 283—297、334—338和339—346区段可能是Q螺旋中心 ，第 21～25、198～200、245～248和 320 323区段可能是8折叠中心。用 Kyte-Doolittle、Emini和 Jmaeson-Wolf方法分别对 Izumo蛋 白B细胞抗原表位进行预测结果表明，蛋 白质第 36～42、62～66、94～ 99、118～122、129～132、151～154、161～164、173～177、205～208、212～216、256～265、271～276、283～288、314—318和 336—350 区段附近很可能为B细胞表位优势区域。结论：该研究结果有助于确定 IZillno蛋白的B细胞优势表位及发挥免疫避孕的活性 部位。 [关键词] 人Izumo蛋白；二级结构；B细胞优势表位 Predictionofthesecondary structureandB cellepitopesforhteIzumoprotein of HomoSapiens YANGXia， Kai—Jun，SHENZi一 ，HEHai一 ，lg，ZHANGJi，ZHANGQiao—Yu，WUYu-Zhang，LI~lg-Tao．In— stituteofIrmnunology，theThirdMilitaryMedicalUniversity，Chongqing绷 38，China lAbstractj Objective：TopredictandanalyzethesecondarystructureandBcellepitopesofIzulnoprotein．Methods：Thesecondary structurenadflexibleregionsofIzumoproteinwerepredictedbythemethodsofChou-Fasmna ，Gamier-RobsonnadKarplus．Schulz．Moreover， hydrophilieityplot，surfaceprobabilityplotnadnatigenicindexofIzunloproteinwerepredictedbythemehtodsofKyte-Doolittle，Emini nad Jmaeson—Wolf，respectively．Remits：Izumoproteincontainedmoreahelixregions．Therewereseveralcentersof helixintheregionsof6-17． 30—40，88—99，103—120，153—160，173—188，249—260，283—297，334—338and339—346ofIzumoprotein，nadseveralcentersof口sheetinthere— gionsof21—25，198—200，245—248nad320—323．Moreover，mnaydistinctBcellepitopesinIzumoproteinpossiblylocalizedinhteregionsof36- 42，62—66，94—99，118—122，129—132，151—154，t61—164，17