绒山羊计算机辅助育种系统-CAMS的设计与实现.pdfVIP

绒山羊计算机辅助育种系统一CAMS的设计与实现 张文广“3，李金泉1，张永斌2，王瑞军1，柴局3 (1内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特，010018 2内蒙古白绒山羊种羊场，鄂尔多斯，016100 3内蒙古ATCG生物信息研究所，呼和浩特，010020) 摘要：本研究针对我国现代绒山羊业发展和种羊场育种管理的需要，以提高种羊选种准确性、自动生成LAMS选配方 Office、DBMS、SAS、 案、改进育种生产效率和种羊质量为目标，运用家畜育种学原理和现代计算机应用技术，以MS 能完成不同规模种羊选种、选配的育种要求以及生产经营任务。CAMS在内蒙古白绒山羊种羊场实际应用体现出了技 术先进、易于操作等特点，对实现种羊场育种工作和生产管理的自动化，提高育种生产效率，具有极大的促进作用。 关键词：绒山羊；育种；计算机；LAMS 1前言 从20世纪20年代数量遗传学诞生以来，动物育种方法和畜牧业生产水平得到了迅速发展与提 高，一些动物遗传育种的新理论和新方法在各畜种中都得到了广泛的应用。20世纪80年代以来， 很多国家开始重视绒山羊的本品种选育和杂交改良。特别是在中国出现了前所未有的绒山羊选育热， 先后开始了对辽宁绒山羊、内蒙古绒山羊和其它品种的绒山羊进行系统选育，建立育种场，组建育 种核心群，健全和完善育种档案记录，开展本品种选育。与此同时，新疆、西藏、甘肃也对当地的 绒山羊进行了系统选育，全国各地引进辽宁绒山羊和内蒙古绒山羊，进行了对本地土种山羊的杂交 改良。但总的说来，绒山羊育种起步较晚，在育种理论和方法上主要表型值选择为主的时期和育种 值选择为主的时期。随着对绒山羊主要经济性状遗传参数、选择反应、后裔测定、选择指数等方面 的研究工作逐渐深入，1998年内蒙古农业大学采用动物模型BLUP法估计了内蒙古白绒山羊抓绒量 和体重的单性状育种值及两性状的综合育种值…，并结合实践应用提出了阶段选择的具体方法。研 究同时指出，对内蒙古绒山羊的选育除了按照动物模型育种值选择外，还要对育种目标性状的遗传 进展进行监测和分析，一方面保证选育性状的可持续改进，另一方面保证其他重要经济性状没有实 了选择方法和配种服务流程比1。 随着我国绒山羊生产向规模化、专业化和集约化方向的不断发展，传统的种羊育种管理方法由 于其数据信息处理效率不高，导致育种操作难度大，效率低下，逐渐成为制约种羊生产改良的瓶颈， 而计算机辅助育种则适应现代育种发展要求，利用现代信息处理工具，能极大地提高育种效率，对 种羊育种和生产提供有效帮助。因此，根据我国绒山羊生产的实际情况，结合家畜育种学理论和现代 计算机应用技术的发展趋势，本着技术先进、方法科学、操作性强、简单易用等原则，开发计算机 AssistedMate 辅助选配服务育种系统一cAMS(Computer Service)对于绒山羊育种和生产具有重要 的理论和实际意义。 基金项目：科技部农业科技成果转化项目2004150020281。 作者简介：张文广(1973--)，男，博七，副教授。研究方向：动物遗传育种。E-mail：zwg—cn@263．net 通讯作者：李金泉(1957一)，男，教授，博上生导师。研究方向：动物遗传育种。Tel：0471-4309195． 89 2育种系统的研究 2．1选种方法 根据内蒙古农业大学绒山羊选育课题组和内蒙古白绒山羊种羊场长期的研究与实践，确定了以 LinearUnbiasedPrediction—EstimatedValue) 选择性状的动物模型BLUP-EBV(Best Breeding Merit 及其边际效益相乘组成的TMI(TotalIndex)作为选留优秀种羊的标准幢1，群体公母羊比例 为1：150。 2．2选配方法 2．2．1同质选配 绒山羊的本品种选育中，每年9～10月根据TMI选留优秀的种公羊和种母羊并在育种群内的各 个选择通径(根据ZPLAN程序优化)中实行个体同质选配，其