利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性.pdfVIP

利用EST-SSR基因分型研究分子标记 与茶树表型性状的关联性 姚明哲 乔婷婷 马春雷 金基强 陈亮杨 亚 军 中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心 摘要：通过EST-SSR标记对112份茶树资源材料进行基因分型，开展了分子标记与新梢一芽二叶长(BL)、 一芽二叶百芽重 (BW)、叶长长度(LL)、叶片宽度(LW)、咖啡碱含量(CAF)、氨基酸含量(AA)和 茶多酚含量(TP)共7个茶树表型性状关联的初步分析。结果表明，在不考虑位点间的连锁不平衡(LD)和 供试群体的结构(SA)时，利用ANOVA方法可检测到三个EST-SSR位点185、121和153与五个表型性状显 著相关，其中标记185同时与4个表型性状BL、BW、LL和LW显著相关，标记121同时与3个表型性状BW、 LL和LW显著相关，而153仅与AA显著相关。但在考虑位点间的连锁不平衡和供试群体结构的情况下，通 过回归分析仅鉴定出2个EST-SSR标记153和84与两个表型性状显著关联，其中标记153与性状LL显著关 联，对表型变异的解释率为0.07，而标记84与性状TP显著关联，对表型的解释率为0.35。两种检测方法中， 仅有一个标记153被同时检出，但与之关联的性状却存在差异。在不考虑供试样本群体结构的情况下，亚群的 混合使整个群体所估计的LD强度增强，可能导致多态性位点与性状的相关性并非由功能性等位基因引起，从 而可能提供了假阳性结果。因此在关联分析前有必要对群体结构进行分析和调节。 茶树；EST-SSR；关联分析；表型性状 TheAssociationAnalysisofPhenotypicTraitswith EST-SSRMarkersinTeaPlants YAOMingzheQIAOTingtingMAChunlei JINJiqiang CHENLiang YANGYajun TeaResearchInstituteChineseAcademyofAgriculturalSciences,NationalCenterforTeaImprovement, Hangzhou310008,China Abstract:TheassociationbetweenEST-SSRmarkersandpenotypictraitswerestudiedbySSRgenotyping.Three EST-SSRlociweredetectedassociationwithfivepenotypictraitsofteabyANOVAmethodsundernoconsidering LDbetweenlociandpopulationstructure.Marker185weresignificantlyrelatedtothelengthoffreshshootswithone budandtwoleaves(BL),theweightof100freshshootswithonebudandtwoleaves(BW),leaflength(LL)andleaf wide(LW)andaminoacidcontents(AA).Marker121wassignificantlyrelatedtoBW,LLandLWwhile153related toAA.However,resultsweredifferentiftheLDbetweenlociandgeneticstructurewereconsidered.Onlytwoloci wereidentifiedassociationwithtwotraits,leaflengthandteapolyphenolscontents(TP),respectively,byregression method.Onlyonemarker153weredetectedinabovebothtwomethod,buttherelatedtraitvaried.Themixtureof populationcouldmakehighdegreeofLDamongthetestedpopulation,anditmightleadtopseudoassociation betweenmarkersandtra