侵染中国甘蔗和玉米的SCMVCP基因序列多样性分析.pdfVIP

中国农业科学 2007,40(1):84-91 Scientia Agricultura Sinica 侵染中国甘蔗和玉米的SCMV CP基因序列多样性分析 周国辉，许东林，陈晓琴 （华南农业大学资源环境学院，广州 510642 ） Sugarcane mosaic virus,SCMV）的遗传多样性， 摘要：【目的】揭示侵染中国甘蔗及玉米的甘蔗花叶病毒（ 为抗病品种培育及病害综合防治提供依据。【方法】以病株叶组织总 RNA 抽提物为模板，通过 RT-PCR 扩增及扩增 产物直接测序获得了华南地区SCMV 26个甘蔗及玉米田间分离物的近全长CP基因序列，结合GenBank中已公布的 部分相应序列，采用序列比对及分子系统进化树重建方法，对SCMV CP基因序列的变异性进行分析。【结果】中国 SCMV可分为3 个分子组群，各组群分别对应于各自来源的寄主，即杂种甘蔗(糖用甘蔗, Saccharum interspecific hybrids)、玉米(Zea mays)和高贵甘蔗（果用甘蔗,Saccharum officinarum ）。CP 基因核苷酸同一性，不同组群 之间为 78%～84%，同一组群内部各分离物之间大于 91%。在分子系统进化树中，这 3 个分子组群各自聚集成簇， 前两个组群分别隶属于Alegria等（2003）建立的甘蔗组（sugarcane group，SCE 组）和玉米组（maize group， MZ 组），第 3 个组群为本研究首次发现，命名为高贵甘蔗组（noble sugarcane group，NSCE 组）。侵染杂种甘蔗 的 SEC 组不存在明显的地域分化，而侵染玉米和高贵甘蔗的 MZ 组和 NSEC 组则可对应地理来源分为若干亚组，前 者可分为华东华中亚组、西北西南亚组及华南亚组，后者至少包括华南亚组和浙江亚组。在玉米、杂种甘蔗及高 贵甘蔗混栽区，不同作物上的SCMV可以通过蚜虫传播而交叉侵染，但各组群间依寄主种类存在相对隔离现象。本 研究还发现中国华南地区，SCMV可自然侵染甘蔗近缘属杂草河八王（Narenga sp.）和芒（Miscanthus sp.）。【结 论】在中国，SCMV存在丰富的遗传多样性，其分化与寄主类型密切相关，可分为杂种甘蔗组、玉米组和高贵甘蔗 组，其中玉米组和高贵甘蔗组又可根据地理来源分为若干亚组。在抗病品种的选育及病害综合防治中，必须充分 考虑到病毒的这种分化现象。 关键词：甘蔗花叶病毒；CP基因；序列分析；遗传分化 Sequence Diversity in the CP Coding Region of Sugarcane Mosaic Virus Isolates Infecting Sugarcane and Maize in China ZHOU Guo-hui, XU Dong-lin, CHEN Xiao-qin (College of Natural Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou 510642) Abstract: 【Objective 】The study was conducted to reveal genetic diversity of Sugarcane mosaic virus (SCMV) isolates infecting sugarcane and maize and to provide theoretical references for resistance breeding and integrated management of mosaic disease in China. 【Method 】26 fragments of the near-full-length SCMV coat protein (CP) gene wer