抗寒蛋白硬脂酰-ACP脱饱和酶的结构与功能预测.pdfVIP

福建农林大学学报 (自然科学版) 第43卷第5期 JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2014年 9月 抗寒蛋白硬脂酰-ACP脱饱和酶的结构与功能预测 罗秀芹，欧文军，李开绵，陈松笔 (中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所／农业部木薯种质资源保护与利用 重点实验室，海南儋州571737) 摘要：采用生物信息学方法对已在GenBank上注册的木薯、木油桐、蓖麻、麻风树、油桐和天山雪莲的△ 硬脂酰．ACP脱饱 和酶(Stearoyl-ACPdesaturase，SAD)核酸序列以及推导的氨基酸序列、组成成分、导肽、跨膜拓扑结构、疏水性、亲水性、蛋 白质二级结构与功能域及三维结构进行分析预测和推断．结果表明：木薯、木油桐、蓖麻、麻风树、油桐和天山雪莲的SAD核 酸序列以及推导的氨基酸序列、组成成分均比较一致；木薯 SAD存在叶绿体转运肽，天山雪莲 SAD存在线粒体 目标肽，均 无跨膜结构；Or-螺旋和无规卷曲是该蛋白质二级结构的主要结构元件，B-转角和延伸链散布于整个蛋白质中，只有一个功 能结构域位于第66—394氨基酸位点． 关键词：木薯；抗寒；硬脂酰一ACP脱饱和酶；结构与功能 中图分类号：s533 文献标识码：A 文章编号：1671-5470(2014)05-0484-06 Thestructureandfunctionpredictionofthecoldresistance enzymestearoyl-ACPdesaturation LUOXiu—qin，OUWen-jun，LIKai—mian，CHENSong-bi (TropicalCropsGeneticResourcesInstitute，ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences(CATAS)／KeyLaboratoryon ProtectionnadUtilizationofCassavaGermplasmResource，MinistryofAgriculture，Danzhou，Hainan571737，China) Abstract：ThenucleiacidandaminoacidsequencesofSADregisteredinGenBankfromManihotesculem口，Verniciamontana，Ric- inuscommwtis，Jatrophacl1．rcas，Vernicia，0 znadSasussuredinvolucratawerenaalyzedandpredictedbythetoolsofbioinformatics inthefollowingaspects：thecomposition ofnucleiacidnadaminoacidsequences，leaderpeptides，trnas—membranetopological structure，hydrophobicityorhydrophiliciyt，secondarystructurenadfunctional domainsofproteinnad3-D structure．Theresults showedhtat：thecompositionofnucleiacidnadaminoacidsequencesofSADin esculenta， montana ，R．communis，J．c ， fordiinads．involucratawereveryconsistent．SADincassavawasahydrophilicnadnon-trails-membraneproteinwihthtechlor~ plastsignalpeptide。whileSADins．involucratawiththemitochondrlatargetpoptide．Th epredictedsecondarystructureofSAD in- chdedOt-hel