猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析.pdfVIP

中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会论文集 猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析 王隆柏”，林裕胜1．2+，车勇良1，吴学敏1，陈如敬1，邵良平2，周伦江p (1．福建省农业科学院畜牧兽医研究所。福建福州350013；2．福建农林大学动物科学院，福建福州350002) ～99．4％，与attenuated 标准株比较，存在多个氨基酸突变，其中有8个变异氨基酸较以往流行毒株不同，为新变异氨基酸，氨基酸的插 入和缺失与2008年泰国NPPED2008 系较近。7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大，可能源于泰国及韩国的变异株。 关键词：猪流行性腹泻病毒；S、N和ORF3基因；变异分析 基因组的转录复制中起到一定的作用，能够诱发机 猪流行性腹泻(PorcineEpidemicDiarrhea，PED) Diarrhea 是由猪流行性腹泻病毒(PorcineEpidemic 体产生有效的免疫应答；ORF3蛋白的多肽性与病 毒毒力存在相关性，因此，研究PEDV的S、N和 Vires，PEDV)Ol起的接触性肠道传染病，各年龄段 的猪群均能感染发病，主要临床症状表现为腹泻、 ORF3基因变异情况，具有重要意义。本研究对 呕吐和脱水，其中对哺乳仔猪危害最为严重。 2012-2013年采自的福建省发生腹泻猪场的病料，挑 PEDV属于尼多病毒目冠状病毒科冠状病毒属的成取7份较有代表性PEDV阳性病料进行结构蛋白的 员，病毒核酸为正义单链RNA，基因组全长约为 克隆测序，在此基础上进行流行毒株的基因变异和 遗传演化分析，以了解福建省流行PEDV毒株基因 28Kb，主要结构蛋白为纤突糖蛋白(s蛋白)、小膜 变异特点，为科学防控PED提供理论依据。 蛋白(E蛋白)、膜蛋白(M蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋 白)Ⅲ。自1978年英国首次报道该病后121，随后世界 各国均有该病的报道。我国于1980年首次报道该1材料和方法 病”1，以后全国各地陆续有PED发生的报道。2010 年下半年，PED在我国各地再次大规模爆发，且临 1．1 床症状比以往更为严重，病死率高达100％，给养 病料，并从中选出具有代表性的7个毒株进行研 S 猪业造成了重大经济损失。有关研究显示，PEDV 究。 蛋白对于分析当地流行毒株的流行情况和遗传变异 起着重要作用la-SI；N蛋白能形成核衣壳，并在病毒扩增试剂盒购自北京全式金生物科技有限公司，Ex contributors *Correspondingauthor；Equal 基金项目：福建省农科院青年创新基金项目(2012DQB-3) t共同第一作者：王隆柏(1977一)，男，福建宁化人，副研究员，主要从事分子生物学与免疫学研究； 林裕胜(1988．)，男，福建漳州人，硕士研究生，主要从事猪流行性腹泻的病原学研究． ·通信作者：E-mail：lunjiang@163．com 一162— 中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会论文集 Inhition、dNTP和DNA象。氨基酸突变表现为：突变情况除与其他国内外 Taq酶、AMV酶、Rnase l8一TVector购自流行野毒株较一致外，还共同出现8个新的变异氨 Marker-2000购自TaKaRa公司，PMD Water基酸，分别在82位由L变为V，97位由A变为s， 宝生生物工程(大连)有限公司，Nucleanse—Free 164位由N变为D，l198位由