中国8个黄牛品种mtDNA+D-loop多态性探析.pdfVIP

反刍动物分子遗传与育种函177 中国8个黄牛品种mtDNA D．100p多态性研究① 雷初朝1② 陈宏1，2@王朝锋1葛庆兰1蔡欣1严林俊2 (1．西北农林科技大学动物乖}技学院，陕西省农业分子生物学重点实验室，杨凌，712100) (2．徐州师范大学细胞与分子生物学研究所，徐州，221儿6) 摘要：本研究对中国8个地方黄牛品种共计33个个体的线粒体DNAD—loop区全序列910bp进行 7个颠换，3个转换／颠换共存。中国8个黄牛品种mtDNA 倍型构建了中国8个黄牛品种的NJ分子系统树。聚类表明，中国黄牛有普通牛和瘤牛2大母系起源。 并探讨了用核苷酸多样度n值的大小来衡量黄牛群体遗传分化程度的可行性。 关键词：黄牛；线粒体DNA；T)．100p；多态性；起源 中国黄牛的起源进化尚无定论。陈宏等…通过对我国一些黄牛Y染色体多态性研究，发现北方黄 牛受普通牛的影响大，南方黄牛受瘤牛的影H向大，中原黄牛同时受普通牛和瘤牛的影响。由于Y染色 体遵循父系遗传方式，因而这个指标只能用于调查黄牛的父系起源。陈幼春_21根摒血液蛋[』位点和Y 染色体特征，辅以体态、毛色特征及史料的考证，认为中国黄牛可能有4种起源：欧洲普通牛、印度瘤牛、 斑腾牛和褐牛。 式、进化速度快等特点。巾的mtDNA K度为910J。正由于其结构和进化上的特点，mtDNA在 D—loop bpL3 动物的系统发育、演化及遗传多样性方面得到了广泛的应用。Yu等’4一对中国12个南方黄牛品种进行 ·ntDNA RⅡP分析，揭示普通牛与瘤¨，f_=是中国南方黄牛的主要起源，但瘤牛的影响更大一些。目前利用 制医进行测序分析，旨在为中国黄牛的起源演化和遗传多样性提供科学依据。 1材料和方法 1．1实验动物 xH)，从GenBank中引用欧洲牛(NC-001567，ST)，瘤牛(L27732)作对照。 1 2 DNA的提取、线粒体DNA D—loop的扩增、纯化及序列测定 牛总DNA的提取方法，线粒体DNA 检测、纯化与回收见文献”J。回收后的PCR产物由北京华大公司测序。 1．3统计分析方法 net @通讯作者：陈宏(1955)，男，教授，博导，专业方向：生物技术与动物遗传育种。E-mai]：cherdlmlgl212@263 178笪史垦塑塑塑堡童登墅塞堂星 2结果 2．1 中国8个黄牛品种mtDNA D．100p区核苷酸位点的突变类型与多态性 中国8个黄牛品种mtDNA910 D．100p bp中，检测到的突变类型有：转换、颠换、插人／缺失(未显示) 及转换与颠换共存；经比对，共发现71个核苷酸多态位点，约占核苷酸总数的7．80％。其中转换61个； 颠换7个；转换与颠换共存位点3个。 2．2 中国黄牛品种mtDNA D—loop单倍型及系统发育树的构建 出现频率最多和最主要的单倍型，共出现8次(渤海黑牛2次、徐闻牛2次、鲁西牛1次、闽南牛1次、赣 次；单倍型YB8出现2次。群体间共享单倍型的存在可能源于古老单倍型，也可能是群体近期分歧或 者群体间存在一些基因流，导致两个群体中出现单倍型共享现象。 起源于瘤牛。 图1中国黄牛D-loop全序列NJ分子系统树(普通牛与瘤牛为对照) 2．3 中国黄牛群体遗传结构分析 根据中国8个黄牛品种33个个体所具有的21单倍型，统计了中国8个黄牛品种中普通牛和瘤牛 两种类型在各品种中的分布以及所占有的单倍型类型(见表1)。从表1可见，在整体上，延边牛受普通 牛的影响，海南牛、徐闻牛与赣南牛受瘤牛的影响，宣汉牛、闽南牛、渤海黑牛与鲁西牛同时受普通牛和 瘤牛的影响，影响程度各品种间有差异。 表1普通牛和瘤牛类型在中国8个黄牛品种中的分布 注：括号内数字为各品种中所观察到的单倍型数 垦鱼塾塑坌